Analyse quantitative des réponses précoces à l'Auxine
Thèses de doctorat
Date de soutenance
2006-10-06Résumé
L’auxine est l’une des principales phytohormones qui assure la croissance de la plante en modulant la coordination et l’enchaînement précis de la division, de l’expansion et de la différenciation cellulaire. Malgré sa ...Lire la suite >
L’auxine est l’une des principales phytohormones qui assure la croissance de la plante en modulant la coordination et l’enchaînement précis de la division, de l’expansion et de la différenciation cellulaire. Malgré sa découverte ancienne, les voies de signalisation de l’auxine restent encore mal connues et peu de données sont disponibles sur la relation entre les gènes de réponse primaire et les mécanismes cellulaires induits par cette hormone. L’action de l’auxine se traduit par l’induction très rapide de réponses cellulaires et moléculaires, dépendantes de sa concentration et montrant une courbe effet-dose spécifique pour chacune d’elles. Sur la base de ces constats notre étude a eu pour objectif d’étudier les premières étapes du mode d’action de l’auxine à l’échelle cellulaire et moléculaire, afin de comprendre comment cette hormone induit autant d’effets pléiotropes. Ce travail a été mené sur les suspensions cellulaires de tabac BY-2, permettant d’enregistrer de manière précoce, en 24 h, des réponses cellulaires spécifiques aux concentrations d’auxine appliquées dans le milieu. Au cours de la première partie du travail, nous avons ainsi mis en évidence l’influence quantitative sur la turgescence et le grandissement cellulaire de faibles concentrations en auxine ainsi que l’effet des concentrations plus élevées sur la division cellulaire. Cette étude a été complétée par l’analyse du profil métabolique des composés solubles ainsi que par le suivi des modifications ultrastructurales des cellules BY-2 dans ces différentes conditions. Afin de comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans ces comportements cellulaires, la deuxième partie du travail a consisté à comparer, par cDNA-AFLP l’expression des gènes des cellules BY-2 répondant aux différentes conditions auxiniques appliquées. Cette étude, menée en collaboration avec le Laboratoire "e;Plant System Biology"e; à l’Université de Gand, a révélé une cinquantaine d’étiquettes de gènes différentiellement exprimés dans les 6 premières heures après l’ajout d’auxine. Parmi celles-ci l’expression de 11 gènes a été validée par RT-PCR semi-quantitative et des expériences en présence de cycloheximide ont permis d’identifier au moins 2 gènes de réponse primaire à l’auxine. Une attention particulière a été portée sur l’un d’eux, C4M41-2, dont l’importance dans la régulation de la prolifération cellulaire induite par l’auxine est discutée< Réduire
Résumé en anglais
Auxin is a major phytohormone which promotes plant development by coordinating cell division, cell expansion and cell differentiation. Although auxin was discovered long time ago, its signaling pathways are not well known ...Lire la suite >
Auxin is a major phytohormone which promotes plant development by coordinating cell division, cell expansion and cell differentiation. Although auxin was discovered long time ago, its signaling pathways are not well known and few data are available on the relationship between auxin primary responsive genes and cellular behaviour. Auxin triggers rapid cellular and molecular responses which depend on its concentration and follow a dose-response curve specific to each of them. Based on these observations, the aim of our project was to study of the early auxinmodulated cellular and molecular responses, in order to understand how this hormone could trigger so many pleiotropic effects. BY-2 cells were used as a cellular model enabling the record of early cellular responses, within 24 hours, according to auxin concentrations in culture medium. During the first part of this work we showed to the fore the quantitative influence of low auxin concentrations on turgor and cell expansion, and of higher concentrations on cell division. Moreover we carried out a metabolic profiling of soluble cellular components and we observed the ultrastructural modifications of BY-2 cells under these hormonal conditions. To understand the molecular mechanisms involved in these cell behaviours, the second part of this work was devoted to a genome-wide cDNA-AFLP based transcriptome analysis of tobacco BY-2 cells, submitted to various auxin treatments. This study was performed in collaboration with the “Plant System Biology” laboratory of Ghent and has revealed about fifty gene tags displaying auxin-dependent differential expression pattern for the first 6 hours after auxin treatment. The validation by RT-PCR was done on 11 of these gene tags. Furthermore, cycloheximide experiments allowed to identify 2 primary auxin responsive genes and particularly C4M41-2, whose importance in the regulation of cell proliferation is discussed with respect to auxin action.< Réduire
Mots clés
Biologie Cellulaire et Moléculaire
auxine
cellules BY-2
division cellulaire
turgescence
gènes de réponse primaire
Unités de recherche