: Analyse protéomique par LC-MS/MS de biopsies hépatiques avec adénocarcinome d’immunophénotype CK7+/CK20-/TTF1-/RE-/RP- : primitif ou secondaire ?

Abstract

Le but de cette étude a été d’explorer les profils protéomiques des cholangiocarcinomes intrahépatiques (CCi) afin d’évaluer leur intérêt pour le diagnostic positif et différentiel sur biopsie hépatique de soin courant. Plus précisément, le but a été d’identifier les protéines différentiellement exprimées (signature protéomique) entre les CCis et certaines localisations secondaires d’adénocarcinomes métastatiques de morphologie voisine exprimant le même immunophénotype peu spécifique CK7+/CK20- /TTF1-/RE-/RP- (sein, poumon, estomac, pancréas), à partir de matériel biopsique FFPE. Si cette technique permet d’orienter vers un primitif en cas de métastase, la prise en charge du patient s’en trouvera modifiée. Pour cela, le savoir-faire de la plateforme Oncoprot de l’équipe INSERM U1053 en matière d’analyse protéomique tissulaire a été sollicité. Ce groupe a développé depuis plusieurs années des techniques de protéomique applicables aux biopsies FFPE de différents organes, dont le foie, et ce dans des domaines de la pathologies tumorale ou non tumorale. Pour notre étude, ce savoir-faire a été appliqué aux biopsies hépatiques de 26 patients avec un diagnostic consolidé de CCi (n = 6), de métastases du sein (n = 4), du poumon (n = 6), de l’estomac (n = 3) et du pancréas (n = 7) répondant au phénotype décrit. Les prélèvements correspondants provenaient du CHU et de l’Institut Bergonié de Bordeaux. Nous avons identifié 114 protéines différentiellement exprimées entre le groupe des CCis et celui des métastases parmi lesquelles la voie de signalisation eIF2 peut être mise en avant.