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dc.contributor.advisorIncerti, Sébastien
dc.contributor.authorKARAMITROS, Mathieu
dc.contributor.otherBaldacchino, Gérard
dc.contributor.otherChampion, Christophe
dc.date2012-11-23
dc.date.accessioned2020-12-14T21:11:12Z
dc.date.available2020-12-14T21:11:12Z
dc.identifier.urihttp://ori-oai.u-bordeaux1.fr/pdf/2012/KARAMITROS_MATHIEU_2012.pdf
dc.identifier.urihttps://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/21748
dc.identifier.nnt2012BOR14629
dc.description.abstractCe travail, réalisé dans le cadre du projet Geant4-DNA, consiste à concevoir un prototype pour la simulation des effets chimiques précoces des rayonnements ionisants. Le modèle de simulation étudié repose sur la représentation particule-continuum où toutes les molécules sont explicitement simulées et où le solvant est traité comme un continuum. La méthode proposée par cette thèse a pour but d'améliorer les performances de ce type de simulation. Elle se base sur (1) la combinaison d'une méthode de pas en temps dynamiques avec un processus de pont Brownien pour la prise en compte des réactions chimiques et afin d'éviter une simulation à pas en temps fixe, coûteuse en temps de calcul, et (2) sur la structure de données k-d tree pour la recherche du voisin le plus proche permettant, pour une molécule donnée, une localisation rapide du réactif le plus proche. La précision de l'algorithme est démontrée par la comparaison des rendements radiochimiques en fonction du temps et en fonction du transfert d'énergie linéaire avec des résultats d'autres codes Monte-Carlo et des données expérimentales. A partir de ce prototype, une tentative de prédiction du nombre et du type d'interactions radicaux-ADN a été entreprise basée sur d'une description simplifiée du noyau cellulaire.
dc.description.abstractEnThe purpose of this work, performed under the Geant4-DNA project, is to design a prototype for simulating early chemical effects of ionizing radiation. The studied simulation model is based on the particle-continuum representation where all the molecules are explicitly simulated, and where the solvent is treated as a continuum. The method proposed by this thesis aims at improving the performance of this type of simulation. It is based on (1) a dynamical time steps method with a Brownian bridge process, to account for chemical reactions, which avoids the costly fixed time-step simulations, and (2) on the k-d tree data structure for quickly locating, for a given molecule, its closest reactants. The accuracy of the algorithm is demonstrated by comparing radiochemical yields over time and depending on the linear energy transfer with results obtained from other Monte Carlo codes and experimental data. Using this prototype, an attempt to predict the number and type of radical attacks on DNA has been performed using a simplified description of the cell nucleus.
dc.language.isofr
dc.subjectRadiolyse
dc.subjectRadiolyse de l'eau
dc.subjectRayonnements ionisants
dc.subjectGeant4-DNA
dc.subjectRadiobiologie
dc.subjectArbre K-D
dc.subjectSmoluchowski
dc.subjectInteractions entre objets dynamiques
dc.subjectInteractions mutuelles
dc.subjectCinétique chimique
dc.subjectModélisation
dc.subjectSimulation Monte-Carlo
dc.subjectBases oxydées
dc.subject.enRadiolysis
dc.subject.enWater radiolysis
dc.subject.enIonizing radiation
dc.subject.enGeant4-DNA
dc.subject.enRadiobiology
dc.subject.enK-D Tree
dc.subject.enSmoluchowski
dc.subject.enDynamical interacting objects
dc.subject.enMutual interactions
dc.subject.enChemical Kinetics
dc.subject.enModeling
dc.subject.enMonte-Carlo simulation
dc.subject.enOxydated bases
dc.subject.enRadiation chemistry
dc.titleExtension de l'outil Monte Carlo généraliste Geant4 pour la simulation de la radiolyse de l'eau dans le cadre du projet Geant4-DNA
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentMoretto, Philippe
bordeaux.hal.laboratoriesThèses de l'Université de Bordeaux avant 2014*
bordeaux.hal.laboratoriesCentre d'études nucléaires Bordeaux Gradignan
bordeaux.institutionUniversité de Bordeaux
bordeaux.type.institutionBordeaux 1
bordeaux.thesis.disciplineAstrophysique, plasma et corpuscules
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale des sciences physiques et de l’ingénieur (Talence, Gironde)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2012BOR14629
dc.contributor.rapporteurSicard-Roselli, Cécile
dc.contributor.rapporteurMontarou, Gérard
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=Extension%20de%20l'outil%20Monte%20Carlo%20g%C3%A9n%C3%A9raliste%20Geant4%20pour%20la%20simulation%20de%20la%20radiolyse%20de%20l'eau%20dans%20le%20cadre%20du%20projet%20&rft.atitle=Extension%20de%20l'outil%20Monte%20Carlo%20g%C3%A9n%C3%A9raliste%20Geant4%20pour%20la%20simulation%20de%20la%20radiolyse%20de%20l'eau%20dans%20le%20cadre%20du%20projet%2&rft.au=KARAMITROS,%20Mathieu&rft.genre=unknown


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