KECK, François; RIMET, Frédéric; BOUCHEZ, Agnes; FRANC, Alain

doi:10.1002/ece3.2051

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KECK, François
Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques [CARRTEL]

RIMET, Frédéric
Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques [CARRTEL]

BOUCHEZ, Agnes
Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques [CARRTEL]

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Article de revue

Ce document a été publié dans

Ecology and Evolution. 2016-03-16, vol. 6, n° 9, p. 2774 - 2780

Wiley Open Access

Résumé en anglais

Phylogenetic signal is the tendency for closely related species to display similar trait values as a consequence of their phylogenetic proximity. Ecologists and evolutionary biologists are becoming increasingly interested in studying the phylogenetic signal and the processes which drive patterns of trait values in the phylogeny. Here, we present a new R package, phylosignal which provides a collection of tools to explore the phylogenetic signal for continuous biological traits. These tools are mainly based on the concept of autocorrelation and have been first developed in the field of spatial statistics. To illustrate the use of the package, we analyze the phylogenetic signal in pollution sensitivity for 17 species of diatoms.< Réduire

Mots clés

autocorrelation

trait evolution

Mots clés en anglais

comparative analysis

phylogenetic correlogram

phylogenetic signal

R software