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dc.contributor.advisorArveiler, Benoît
dc.contributor.authorPENNAMEN, Perrine
dc.contributor.otherArveiler, Benoît
dc.contributor.otherTaïeb, Alain
dc.contributor.otherRoux, Anne-Françoise
dc.contributor.otherVidaud, Dominique
dc.contributor.otherOdent, Sylvie
dc.date2021-04-06
dc.identifier.urihttp://www.theses.fr/2021BORD0136/abes
dc.identifier.urihttps://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03254455
dc.identifier.nnt2021BORD0136
dc.description.abstractL’albinisme est une affection de la pigmentation caractérisée par l’association d’anomalies oculaires à divers degrés d’hypopigmentation cutanéo-phanérienne et parfois des atteintes systémiques dans les formes syndromiques que sont les syndromes d’Hermansky-Pudlak (HPS) et le syndrome de Chediak-Higashi. Avant ce travail, 19 gènes étaient connus comme impliqués dans des formes isolées ou syndromiques d’albinisme, dont la plupart sont autosomiques récessives à l’exception de l’albinisme oculaire lié à l’X. Après étude complète de ces 19 gènes, environ 25% à 30% des patients restent sans diagnostic moléculaire. Afin de rechercher de nouveaux gènes, nous avons développé et testé un panel de 129 gènes candidats chez 230 patients non résolus sur le plan moléculaire. Ceci a permis de mettre en évidence des variants délétères dans deux nouveaux gènes. Nous rapportons d’une part deux patientes porteuses de variants perte de fonction dans le gène BLOC1S5, une délétion intragénique homozygote emportant les exons 3 et 4 et une délétion homozygote d’une paire de base (pb) de l’exon 4. BLOC1S5 code une des sous-unités du complexe BLOC-1 qui en compte huit et dont 3 sont déjà associées à des formes d’HPS (7, 8, 9). Ces patientes présentent un phénotype d’albinisme modéré et un défaut d’agrégation plaquettaire par déficit en granules denses. Les plaquettes de la patiente 1 présentent une absence de BLOC-1 montrant que la délétion entraine une dysfonction de BLOC1S5 gênant l’assemblage du complexe. Tandis que l’expression du transcrit humain sauvage de BLOC1S5, dans des mélanocytes murins avec KO de BLOC1S5, non pigmentés, restaure la pigmentation, l’assemblage de BLOC-1 et le trafic de cargo, l’expression du transcrit avec la délétion de la 1ere patiente ne le permet pas. Nous avons ainsi démontré que la perte de fonction de BLOC1S5 est responsable d’une nouvelle forme d’HPS, HPS-11. Le deuxième gène, DCT ou TYRP2 est suspecté de longue date du fait de sa collaboration à la synthèse de la mélanine avec TYR et TYRP1, gènes connus d’albinisme (OCA1 et 3, respectivement). Nous décrivons 2 patientes présentant un albinisme cutané modéré avec atteinte ophtalmologique caractéristique et porteuses de variants de DCT. Une patiente est homozygote pour un variant faux sens de l’exon 1 et l’autre hétérozygote composite pour un variant faux sens de l’exon 1 et une délétion de 14pb de l’exon 9. Les deux variants faux-sens sont situés dans des cystéines très conservées et ont été induits chez la souris par CrispR-Cas9, reproduisant l’hypopigmentation modérée et l’atteinte oculaire. Un modèle poisson zèbre a aussi été produit avec atteinte similaire. Nous concluons donc que DCT est impliqué dans une nouvelle forme d’albinisme oculo-cutané, OCA8. Enfin nous rapportons également le phénotype détaillé de trois patients porteurs de nouveaux variants dans BLOC1S3, associé à l’HPS-8, une des formes les plus rares d’albinisme syndromique. Avant ce travail seulement 2 familles et deux variants étaient décrits dans la littérature. La description détaillée du phénotype de ces patients est une aide aux praticiens dans l’accompagnement diagnostique et pronostique des patients ainsi que pour le conseil génétique. Nous avons donc rapporté deux nouveaux gènes d’albinisme, pour une forme oculocutanée et pour une forme syndromique (HPS), toutes deux apparemment modérées et décrivons de nouveaux variants pour une forme connue mais néanmoins rare d’albinisme syndromique.
dc.description.abstractEnAlbinism is a pigmentation disorder characterized by visual impairment, isolated (Ocular Albinism, OA) or associated with generalized skin and hair hypopigmentation (Oculo-Cutaneous Albinism, OCA), and sometimes with other symptoms in syndromic forms called Hermansky-Pudlak (HPS) and Chediak-Higashi (CHS) syndromes. Most are autosomal recessive affections except for X-linked OA. Prior to this work 19 genes were known to cause isolated or syndromic albinism. After extensive analysis of these genes, 25 to 30% of patients remain molecularly unsolved. To search for new genes we screened, in 230 patients without molecular diagnosis, a panel of 129 candidate genes. We identified deleterious variants in two candidate genes. First, we report two patients with predicted loss-of-function variants in BLOC1S5 in two patients. The first patient carries an intragenic homozygous deletion involving exons 3 and 4. The second patient has a homozygous one base-pair deletion in exon 4. BLOC1S5 codes for one of the 8 subunits of BLOC-1, three of which are involved HPS-7, 8 and 9. Both patients had mild hypopigmentation, classical ocular albinism and moderate bleeding diathesis, platelet aggregation deficit and a very low number of platelet dense granules, compatible with HPS. Patient 1’s platelets displayed an absence of BLOC-1, showing that the identified mutation disrupts BLOC1S5 function and impairs BLOC-1 assembly. Whereas expression of a wild-type BLOC1S5 protein in non-pigmented murine melanocytes rescued pigmentation, assembly of a functional BLOC-1, and melanosome cargo trafficking, expression of the patient's BLOC1S5 variant allele did not. These data indicate that mutation of BLOC1S5 is disease-causing, and we propose that BLOC1S5 is the gene for a new form of HPS, HPS11. The second gene, DCT or TYRP2 has been suspected for a long time, due to its collaboration with TYR (OCA1) and TYRP1 (OCA3). We describe two unrelated patients presenting with clinical diagnosis of OCA. One patient is homozygous for a missense variant in the exon 1 of DCT and the other is a compound heterozygote for a missense variant in exon 1 and a frame-shift deletion in exon 9. Both missense variants, affecting highly conserved cysteine, were introduced in mice via Crispr-Cas9, which led to mild hypopigmentation of the fur and ocular anomalies. A Zebrafish knock-down model has also been produced by morpholino injection, leading to a significant decrease in melanin levels compared to controls. We propose that DCT is the gene for a new form of OCA, OCA8. In this work we also describe three unrelated patients with novel variants in BLOC1S3 responsible for HPS-8. This rare form of HPS had been reported in only two families and we believe detailed clinical description of patients is useful for clinicians for patient’s diagnosis and prognosis evaluation and genetic counseling. In conclusion we have reported two new genes involved in isolated and syndromic forms of albinism as well as new insight in an already known yet rare form of syndromic albinism.
dc.language.isofr
dc.subjectMaladies génétiques rares
dc.subjectGénétique moléculaire
dc.subjectExome
dc.subjectAlbinisme
dc.subjectAnalyses fonctionnelles
dc.subject.enRare genetic diseases
dc.subject.enMolecular genetics
dc.subject.enExome
dc.subject.enAlbinism
dc.subject.enFunctional analyses.
dc.titleRecherche et caractérisation de nouveaux gènes impliqués dans l’albinisme
dc.title.enSearch and characterization of new genes involved in albinism
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentTaïeb, Alain
bordeaux.hal.laboratoriesU 1211 Laboratoire Maladies Rares: Génétique et Métabolisme (Bordeaux) / MRGM
bordeaux.hal.laboratoriesMaladies rares : génétique et métabolisme (Bordeaux)
bordeaux.type.institutionBordeaux
bordeaux.thesis.disciplineGénétique
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale Sciences de la vie et de la santé (Bordeaux)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2021BORD0136
dc.contributor.rapporteurRoux, Anne-Françoise
dc.contributor.rapporteurVidaud, Dominique
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=Recherche%20et%20caract%C3%A9risation%20de%20nouveaux%20g%C3%A8nes%20impliqu%C3%A9s%20dans%20l%E2%80%99albinisme&rft.atitle=Recherche%20et%20caract%C3%A9risation%20de%20nouveaux%20g%C3%A8nes%20impliqu%C3%A9s%20dans%20l%E2%80%99albinisme&rft.au=PENNAMEN,%20Perrine&rft.genre=unknown


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