Ecophysiologie expérimentale des bactéries phototrophes sulfo-oxydantes dans les systèmes sédimentaires

Abstract

Les bactéries phototrophes anoxygéniques sulfo-oxydantes prolifèrent dans les écosystèmes aquatiques peu profonds. Dans ce travail, nous étudions l'écophysiologie de ces micro-organismes dans des systèmes submergés par une colonne d'eau de profondeur supérieure à 1 mètre. Dans ce cas, la colonne d'eau absorbe les rayons proches de l'infrarouge (IR) de telle sorte que l'intensité lumineuse à la surface du sédiment est amoindrie et le spectre lumineux majoritairement constitué de longueurs d'ondes proches du visible. Ces conditions sont alors critiques pour la croissance des Chlorobiaceae et des Chromatiaceae. La culture en sédiment artificiel de Prosthecochloris aestuarii (Chlorobiaceae) a mis en évidence une hétérogénéité spatiale des conditions limitantes pour la photosynthèse et la croissance. De plus, cette souche bactérienne est capable de réagir à l'addition de rayons IR. La culture en sédiment artificiel, d'un biofilm mixte de P. aestuarii et de Thiocapsa roseopersicina (Chromatiaceae) a montré que les micro-organismes coexistent à la mêmeprofondeur. Les interactions entre les deux souches bactériennes sont positives pour la bactérie verte dont la biomasse est nettement supérieure comparée à celle estimée en culture axénique. Aucun effet de la coculture n'a été démontré sur T. roseopersicina. Enfin, les adaptations pigmentaires de deux souches de bactéries vertes, P. aestuarii et Chlorobium phaeobacteroides, ont été étudiées à différentes intensités de lumière verte simulant différentes profondeurs de la colonne d'eau. La réponse adaptative est propre à chaque espèce étudiée. Chez P. aestuarii, une seule forme de bactériochlorophylle c estérifiée avec le farnesyl est présente. Chez C. phaeobacteroides, la bactériochlorphyll e comprend une grande quantité de formes de bactériochlorophylle e, estérifiées avec des alcools à chaîne linéaire et isoprénoides dont la proportion varie avec l'intensité lumineuse.