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dc.contributor.advisorNallet, Frédéric
dc.contributor.advisorNavailles, Laurence
dc.contributor.authorTEIXEIRA DA SILVA, Emerson Rodrigo
dc.contributor.otherCarvalho de abreu fantini, Márcia
dc.contributor.otherLevin, Yan
dc.contributor.otherDa Pesce Silveira, Nadya
dc.date2011
dc.date.accessioned2020
dc.date.accessioned2020
dc.date.available2020
dc.date.available2020
dc.identifier.urihttps://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/21041
dc.identifier.nnt2011BOR14342
dc.description.abstractUne étude expérimentale sur la structure et la dynamique d'un complexe hydraté de fragments d'ADN (150 pb) et des phases lamellaires de lipides non-cationiques est présentée. Par la variation de d'hydratation, il est possible de contrôler le confinement imposé par cette matrice hôte sur les nucléotides insérés dans les couches aqueuses. L’organisation supramoléculaire du complexe est suivie par diffraction des rayons-X et des techniques de microscopie optique et électronique. Un riche polymorphisme de mésophases est observé en fonction du confinement. Dans le régime plus hydraté, les fragments se distribuent selon une orientation nématique. Dans la mesure où la quantité de l'eau diminue, le confinement des bicouches sur les nucléotides monte et des corrélations trans-membranaires donnent origine à des phases hautement organisées, avec de symétries rectangulaires et hexagonales (2D) d'ADN dans la phase lipidique. L'incorporation totale des nucléotides par la phase lamellaire est observée uniquement lorsque des grandes quantités d'ADN y sont présentes. Ce fait souligne une importance majeur des interactions de volume exclu. Une analyse du paramètre de Caillé montre que l'insertion des fragments diminue les fluctuations des membranes. À partir des ces observations, il est suggéré que la modification des interactions stériques entre des lamelles, associée à des effets interfaciaux ADN-membranes, est un mécanisme important dans le comportement de phases. Les propriétés dynamiques sont étudiés avec la technique de retour de fluorescence après photo-blanchiment (FRAP). Un modèle développé récemment pour l'analyse de diffusion anisotrope est testé avec succès, démontrant une corrélation proche entre structure et dynamique.
dc.description.abstractEnAn experimental study on the structural and dynamical properties of a hydrated DNA-non-cationic complex is presented. By varying the water amount, it is possible to control the confinement imposed by this host matrix over the organization of the nucleotides inserted within the water layers. The supramolecular assembly is investigated by X-rays diffraction and techniques involving both optical and electron microscopy. A rich polymorphism of mesophases is observed in function of confinement. In the more hydrated regime, the fragments are distributed according to nematic orientation in-between lamellae. As the water amount decreases, the confinement of bilayers over the particles increases and transmembrane correlations appear, giving raise to highly-ordered phases, with 2D-rectangular and -hexagonal symmetries of DNA embodied in the lamellar phase. The full incorporation of nucleotides by the lamellar phase is observed only in the presence of large amounts of DNA. This finding points to major importance of excluded volume interactions. An analysis of the Caillé parameter shows that the insertion of DNA reduces the fluctuations of membranes. From these observations, it is suggested that changes in the interactions between bilayers, together with the appearance of interfacial effects between DNA and membranes, are a mechanism relevant for the phase behavior of these systems. The dynamical properties of nucleotides are investigated through the fluorescence recovery after photobleach (FRAP). A model recently developed for analyses of anisotropic diffusion is sucessfully tested, demonstrating a close relationship between structure and dynamics.
dc.language.isoen
dc.subjectComplexe ADN-lipide
dc.subjectAuto-assemblage
dc.subjectConfinement
dc.subjectPhase lamellar
dc.subjectNanostructure
dc.subjectPhase hexagonale
dc.subjectDiffusion anisotrope
dc.subjectMésophase
dc.subject.enDNA-lipid complex
dc.subject.enSelf-assembly
dc.subject.enConfinement
dc.subject.enLamellar phase
dc.subject.enNanostructure
dc.subject.enHexagonal phase
dc.subject.enAnisotropic diffusion
dc.subject.enMesophase
dc.titleStructure et dynamique d'ADN confinée entre des membranes lipidiques non-cationiques
dc.title.enStructure and dynamics of DNA confined in-between non-cationic lipid membranes
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentAndreoli de oliveira, Elisabeth
bordeaux.hal.laboratoriesThèses de l'Université de Bordeaux avant 2014*
bordeaux.hal.laboratoriesThèses de l'université de Bordeaux 1
bordeaux.hal.laboratoriesCentre de Recherche Paul Pascal (Pessac)
bordeaux.type.institutionBordeaux 1
bordeaux.thesis.disciplineLasers, matières et nanosciences
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale des sciences physiques et de l’ingénieur (Talence, Gironde)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2011BOR14342
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=Structure%20et%20dynamique%20d'ADN%20confin%C3%A9e%20entre%20des%20membranes%20lipidiques%20non-cationiques&rft.atitle=Structure%20et%20dynamique%20d'ADN%20confin%C3%A9e%20entre%20des%20membranes%20lipidiques%20non-cationiques&rft.au=TEIXEIRA%20DA%20SILVA,%20Emerson%20Rodrigo&rft.genre=unknown


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