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Microbial biomarkers of tree water status for next‐generation biomonitoring of forest ecosystems

hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorCAMBON, Marine
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorTRILLAT, Marine
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
hal.structure.identifierHelixVenture
dc.contributor.authorLESUR‐KUPIN, Isabelle
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorBURLETT, Régis
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorCHANCEREL, Emilie
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorGUICHOUX, Erwan
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorPIOUCEAU, Lucie
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorCASTAGNEYROL, Bastien
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorLE PROVOST, Grégoire
hal.structure.identifierLaboratoire des Protéines et Systèmes Membranaires [LPSM]
dc.contributor.authorROBIN, Stéphane
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorRITTER, Yves
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorVAN HALDER, Inge
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorDELZON, Sylvain
hal.structure.identifierAgroécologie [Dijon]
dc.contributor.authorBOHAN, David
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
hal.structure.identifierUniversité de Bordeaux [UB]
dc.contributor.authorVACHER, Corinne
dc.date.issued2023-10-10
dc.identifier.issn0962-1083
dc.description.abstractEnNext-generation biomonitoring proposes to combine machine-learning algorithms with environmental DNA data to automate the monitoring of the Earth's major ecosystems. In the present study, we searched for molecular biomarkers of tree water status to develop next-generation biomonitoring of forest ecosystems. Because phyllosphere microbial communities respond to both tree physiology and climate change, we investigated whether environmental DNA data from tree phyllosphere could be used as molecular biomarkers of tree water status in forest ecosystems. Using an amplicon sequencing approach, we analysed phyllosphere microbial communities of four tree species (Quercus ilex, Quercus robur, Pinus pinaster and Betula pendula) in a forest
dc.description.sponsorshipBiosurveillance Next-Gen des changements dans la structure et le fonctionnement des écosystèmes
dc.description.sponsorshipDiversité et Productivité des forêTs impactées par le Changement Climatique - ANR-16-CE32-0003
dc.language.isoen
dc.publisherWiley
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/
dc.subject.enenvironmental DNA data
dc.subject.enmachine-learning algorithms
dc.subject.enmolecular biomarkers
dc.subject.ennext-generation biomonitoring
dc.subject.enphyllosphere microbial communities
dc.subject.enwater stress
dc.title.enMicrobial biomarkers of tree water status for next‐generation biomonitoring of forest ecosystems
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.1111/mec.17149
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]
bordeaux.journalMolecular Ecology
bordeaux.page5944-5958
bordeaux.volume32
bordeaux.issue22
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-04272156
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceInternationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-04272156v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.jtitle=Molecular%20Ecology&rft.date=2023-10-10&rft.volume=32&rft.issue=22&rft.spage=5944-5958&rft.epage=5944-5958&rft.eissn=0962-1083&rft.issn=0962-1083&rft.au=CAMBON,%20Marine&TRILLAT,%20Marine&LESUR%E2%80%90KUPIN,%20Isabelle&BURLETT,%20R%C3%A9gis&CHANCEREL,%20Emilie&rft.genre=article


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