Vers une recherche reproductible

DESQUILBET, Loic; GRANGER, Sabrina; HEJBLUM, Boris; LEGRAND, Arnaud; PERNOT, Pascal; ROUGIER, Nicolas; DE CASTRO GUERRA, Elisa; COURBIN-COULAUD, Martine; DUVAUX, Ludovic; GRAVIER, Pierre; LE CAMPION, Grégoire; ROUX, Solenne; SANTOS, Frédéric

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Faire évoluer ses pratiques

DESQUILBET, Loic
École nationale vétérinaire d'Alfort [ENVA]

GRANGER, Sabrina
Université de Bordeaux [UB]

HEJBLUM, Boris
Statistics In System biology and Translational Medicine [SISTM]

Langue

Ouvrage

Ce document a été publié dans

2019-05p. 1-161

Unité régionale de formation à l'information scientifique et technique de Bordeaux

Résumé

Pour un chercheur, il n’y a rien de plus frustrant que l’impossibilité de reproduire des résultats majeurs obtenus quelques mois auparavant. Les causes de ce type de déconvenues sont multiples et parfois pernicieuses. Ce phénomène participe à ce que certains identifient comme une “crise de la reproductibilité de la recherche”.Cet ouvrage considère un ensemble de situations et de pratiques potentiellement dangereuses afin d’illustrer et de mettre en évidence les symptômes de la non-reproductibilité dans la recherche. À chaque fois, il propose un éventail de solutions allant de bonnes pratiques faciles et rapides à implémenter jusqu’à des outils plus techniques, tous gratuits et mis à l’épreuve par les auteurs eux-mêmes.Dans ce livre rédigé lors d’un book sprint, étudiants, ingénieurs et chercheurs devraient trouver des moyens efficaces et à leur portée pour améliorer leurs pratiques de la recherche reproductible.< Réduire

Résumé en anglais

For a researcher, there is nothing more frustrating than the failure to reproduce major results obtained a few months back. The causes of such disappointments can be multiple and insidious. This phenomenon plays an important role in the so-called “research reproducibility crisis”.This book takes a current perspective onto a number of potentially dangerous situations and practices, to examplify and highlight the symptoms of non-reproducibility in research. Each time, it provides efficient solutions ranging from good-practices that are easily and immediately implementable to more technical tools, all of which are free and have been put to the test by the authors themselves.With this book written during a book sprint, students and engineers and researchers should find efficient and accessible ways leading them to improve their reproducible research practices.< Réduire

Mots clés

Transparence de la recherche

Recherche reproductible

Standardisation

Crise de la réplication

Science ouverte

Réutilisation des données

Mots clés en anglais

Open source

Book sprint

Data sharing

Open science

Data reusability

Research transparency

Replication crisis

Reproducible research

Standardization

Open data

Origine

Importé de hal

Unités de recherche

Passages - UMR 5319