CAMPOY, José; LERIGOLEUR, Emilie; CHRISTMANN, Hélène; BEAUVIEUX, Rémi; GIROLLET, Nabil; QUERO-GARCIA, José; DIRLEWANGER, Elisabeth; BARRENECHE, Teresa

doi:10.1186/s12870-016-0712-9

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CAMPOY, José
Biologie du fruit et pathologie [BFP]

LERIGOLEUR, Emilie
Géographie de l'environnement [GEODE]

CHRISTMANN, Hélène
Biologie du fruit et pathologie [BFP]

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Article de revue

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BMC Plant Biology. 2016, vol. 16, n° 1, p. 1-15

BioMed Central

Résumé en anglais

Depiction of the genetic diversity, linkage disequilibrium (LD) and population structure is essential for the efficient organization and exploitation of genetic resources. The objectives of this study were to (i) to evaluate the genetic diversity and to detect the patterns of LD, (ii) to estimate the levels of population structure and (iii) to identify a 'core collection' suitable for association genetic studies in sweet cherry.The present study constitutes the first population genetics analysis in cultivated sweet cherry using a medium-density SNP (single nucleotide polymorphism) marker array. We provided estimations of linkage disequilibrium, genetic structure and the definition of a first INRA’s Sweet Cherry core collection useful for breeding programs, germplasm management and association genetics studies.< Réduire

Mots clés en anglais

Linkage disequilibrium

Population structure

Germplasm management

Association genetics

Core collection

Discriminant analysis

Genetic diversity

Prunus avium

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Genetic diversity, linkage disequilibrium, population structure and construction of a core collection of Prunus avium L. landraces and bred cultivars

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