FERNANDEZ, Olivier; URRUTIA, Maria; BERNILLON, Stéphane; GIAUFFRET, Catherine; TARDIEU, Francois; LE GOUIS, Jacques; LANGLADE, Nicolas; CHARCOSSET, Alain; MOING, Annick; GIBON, Yves

doi:10.1007/s11306-016-1099-1

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FERNANDEZ, Olivier
Biologie du fruit et pathologie [BFP]

URRUTIA, Maria
Biologie du fruit et pathologie [BFP]

BERNILLON, Stéphane
Biologie du fruit et pathologie [BFP]

Langue

Article de revue

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Metabolomics. 2016, vol. 12, n° 10

Springer Verlag

Résumé en anglais

Background: In the last decade, metabolomics has emerged as a powerful diagnostic and predictive tool in many branches of science. Researchers in microbes, animal, food, medical and plant science have generated a large number of targeted or non-targeted metabolic profiles by using a vast array of analytical methods (GC–MS, LC–MS, 1H-NMR….). Comprehensive analysis of such profiles using adapted statistical methods and modeling has opened up the possibility of using single or combinations of metabolites as markers. Metabolic markers have been proposed as proxy, diagnostic or predictors of key traits in a range of model species and accurate predictions of disease outbreak frequency, developmental stages, food sensory evaluation and crop yield have been obtained. Aim of review : (i) To provide a definition of plant performance and metabolic markers, (ii) to highlight recent key applications involving metabolic markers as tools for monitoring or predicting plant performance, and (iii) to propose a workable and cost-efficient pipeline to generate and use metabolic markers with a special focus on plant breeding. Key message: Using examples in other models and domains, the review proposes that metabolic markers are tending to complement and possibly replace traditional molecular markers in plant science as efficient estimators of performance.< Réduire

Mots clés

Metabolomics

Mots clés en anglais

Breeding

Metabolic marker

Plant performance

Prediction

DOI

http://dx.doi.org/10.1007/s11306-016-1099-1

Projet Européen

Drought-tolerant yielding plants

Project ANR

Ressources génétiques de tournesol pour l'amélioration de la stabilité de production d'huile sous c - ANR-11-BTBR-0005
Développer de nouvelles variétés de maïs pour une agriculture durable: une approche intégrée de la génomique à la sélection - ANR-10-BTBR-0001
Développer de nouvelles variétés de blé pour une agriculture durable
Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation
Centre français de phénomique végétale

Origine

Importé de hal

Unités de recherche

Biologie du Fruit & Pathologie (BFP) - UMR 1332