Molecular characterization of Cordyline virus 1 isolates infecting yam (Dioscorea spp)
DIOUF, Mame Boucar
Agrosystèmes tropicaux [ASTRO]
Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP]
Département Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
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DIOUF, Mame Boucar
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FILLOUX, Denis
Plant Health Institute of Montpellier [UMR PHIM]
Département Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
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ROUMAGNAC, Philippe
Plant Health Institute of Montpellier [UMR PHIM]
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TEYCHENEY, Pierre-Yves
Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical [UMR PVBMT]
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Langue
en
Article de revue
Ce document a été publié dans
Archives of Virology. 2022, vol. 167, p. 2275-2280
Springer Verlag
Résumé en anglais
Cordyline virus 1 (CoV1) is a velarivirus that has so far only been reported in ornamental Ti plants (Cordyline fruticosa). Using high-throughput sequencing, we identified CoV1 infection in yam accessions from Vanuatu. ...Lire la suite >
Cordyline virus 1 (CoV1) is a velarivirus that has so far only been reported in ornamental Ti plants (Cordyline fruticosa). Using high-throughput sequencing, we identified CoV1 infection in yam accessions from Vanuatu. Using a specific RT-PCR assay, we found that CoV1 is also present and highly prevalent in Dioscorea alata, D. cayenensis, and D. trifida in Guadeloupe. Phylogenetic analysis showed that CoV1 isolates infecting yam in Guadeloupe display a low level of molecular diversity. These data provide insights into the transmission of CoV1 in yam in Guadeloupe.< Réduire
Mots clés en anglais
Cordyline virus 1
velarivirus
high-throughput sequencing
Yam
Dioscorea
Project ANR
Amélioration du diagnostic viral pour sécuriser les ressources génétiques végétales - ANR-11-EBIM-0002
Origine
Importé de halUnités de recherche