FaMoz un logiciel pour faire des études de parenté à partir de marqueurs codominants et dominants

Abstract

FaMoz (un acronyme pour père/mère -father/mother- en anglais) est un logiciel utile pour reconstruire des parentés à partir de marqueurs dominants et codominants. Il est écrit dans les langages C et TclTk et est téléchargeable et utilisable sur des systèmes Unix, Linux et Windows. Les paramètres et les hypothèses utilisées dans les calculs sont peu nombreux et simples. Les probabilités d'identité et d'exclusion, les log-vraisemblances des pères, parents et paires de parents potentiels sont calculées à partir de données réelles ou simulées. Des taux d'erreur, liés à de mauvais génotypages, peuvent être introduits. Des simulations peuvent être faites pour construire des tests statistiques afin d'affecter les parentés.