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dc.contributor.advisorMalvy, Denis
dc.contributor.authorDUVIGNAUD, Alexandre
dc.contributor.otherMalvy, Denis
dc.contributor.otherLafon, Marie-Edith
dc.contributor.otherBottieau, Emmanuel
dc.contributor.otherLamballerie, Xavier de
dc.contributor.otherMentré, France
dc.contributor.otherTattevin, Pierre
dc.date2020-12-11
dc.identifier.urihttp://www.theses.fr/2020BORD0254/abes
dc.identifier.uri
dc.identifier.urihttps://tel.archives-ouvertes.fr/tel-03506245
dc.identifier.nnt2020BORD0254
dc.description.abstractLa fièvre de Lassa, maladie endémique à recrudescence épidémique saisonnière, est avec 300 000 cas et 5000 décès annuels estimés à travers toute l’Afrique de l’Ouest considérée comme une priorité en terme de recherche. Ces dernières années, le Nigeria a rapporté un nombre de cas annuel en constante augmentation, dépassant désormais le millier. Mais cinquante ans après sa découverte, les connaissances sur la maladie restent parcellaires et la recherche clinique peu structurée. L’efficacité du seul traitement recommandé, la ribavirine, est aujourd’hui remise en cause. Il apparait donc urgent de pouvoir disposer de données actualisées, précises et fiables sur la maladie, son cours évolutif, sa prise en charge, son pronostic et les facteurs qui y sont associés. Il est également important que les malades qui en souffrent puissent avoir accès à un standard de soins optimisé. Il est enfin indispensable de développer les capacités de recherche clinique en zone d’endémie.Dans cette thèse, nous faisons une synthèse des connaissances accumulées sur la fièvre de Lassa depuis sa découverte en 1969. Puis nous exposons les raisons qui nous ont conduits à mettre en place un programme de réponse et de recherche sur la fièvre de Lassa. Nous expliquons la démarche suivie pour renforcer le standard de soins et mettre en place une plateforme de recherche clinique en collaboration avec l’un des principaux centres de prise en charge de la fièvre de Lassa au Nigeria. Nous présentons les premiers résultats de l’étude de cohorte prospective LASCOPE qui inaugura ce programme.Entre avril 2018 et mars 2020, ce sont 534 patients atteints de fièvre de Lassa prouvée par RT-PCR qui ont été pris en charge dont 77 (14,4%) sont décédés. 510 participants ont été inclus. Parmi eux on dénombrait 258 hommes et 252 femmes ; 84 étaient des enfants. Le délai médian entre l’apparition des symptômes et l’admission était de 8 jours (IIQ 7-13). A l’admission, 37,8% avaient une valeur de Ct de la RT-PCR du gene GPC du virus de Lassa <30. Entre l’admission et la fin du suivi, 120 (26,5%) ont atteints un score NEWS2 ≥7, 67(13,5%) un stade KDIGO ≥2 et 41 (8,0%) ont été dialysés. Tous ont reçu de la ribavirine pendant une durée médiane de 10 jours (IIQ 9-13). 62 (12,2%) sont décédés (57 [13,4%] adultes, 5 [6,0%] enfants. Le délai médian entre l’admission et le décès était de 3 jours (IIQ 1-6). Les caractéristiques suivantes à l’admission étaient associées à la mortalité en analyse multivariable : l’âge ≥ 45 ans (Odds Ratio ajusté [aOR] 16,30 [IC95% 5,31-50,30]), un score NEWS2 ≥7 (aOR 4,79 [IC95% 1,75-13,10]), un stade KDIGO ≥2 (aOR 7,52 [IC95% 2,66-21,20]), une valeur d’ALAT ≥ 3 fois la limite supérieure de la normale (aOR 4,96 [IC95% 1,69- 14,60]) et une valeur de Ct de la RT-PCR Lassa <30 (aOR 4,65 [IC95% 1,50-14,50]). Ces résultats devraient s’avérer utiles pour la conception de futurs essais cliniques mais aussi pour l’actualisation des recommandations de prise en charge de la maladie. Le cadre de cette étude de cohorte nous a également permis de documenter et décrire une présentation atypique de la maladie, sous la forme d’une paraparésie d’apparition retardée. Cette observation originale vient compléter le spectre évolutif des manifestations neurologiques de la fièvre de Lassa.Deux études complémentaires sont nichées dans la cohorte LASCOPE, portant respectivement sur la pharmacocinétique de la ribavirine telle qu’employée dans le traitement de la fièvre de Lassa et sur la physiopathologie de l’atteinte cardio-circulatoire pouvant survenir au cours de la maladie. Le recrutement dans ces études nichées est toujours en cours.Enfin, un essai clinique de phase II évaluant la pharmacocinétique, la sécurité et la tolérance d’un nouvel antiviral, le favipiravir, pour le traitement de la fièvre de Lassa est également en cours de mise en place sur deux sites au Nigeria dont celui avec lequel nous collaborons.
dc.description.abstractEnLassa fever, an endemic disease with seasonal epidemic recrudescence, is considered to be responsible for 300 000 cases and 5000 death each year throughout Western Africa. As such, it has been listed as a priority for research. Over the past few years, Nigeria reported the highest and ever increasing number of cases, now exceeding a thousand per year. However, fifty years after the discovery of the disease, our knowledge is still limited and clinical research capacities remained poorly developed. The efficacy of the only available treatment, ribavirin, is still to be assessed. Hence, there is a need for up to date and reliable data on the disease course, management, mortality and prognostic factors. It is also of paramount importance that the patients suffering from Lassa fever could gain access to an optimised standard of care. Lastly, clinical research capacities need to be developed urgently in endemic areas.In this thesis, we review the knowledge gathered on Lassa fever from its discovery in 1969 till date. Then, we explain the reasons that led us to set up a response and research program on Lassa fever, as well as our approach to reinforce the standard of care and build a clinical research platform in collaboration with one of the main Lassa treatment centres in Nigeria. Next, we present the first results of the LASCOPE cohort study which represent the cornerstone of our program.From April 2018 to March 2020, 534 patients with RT-PCR proven Lassa fever were followed-up of whom 77 died (14.4%). 510 participants were enrolled in the cohort: 258 men and 252 women, 84 being children. The median delay between the symptoms onset and admission was 8 days (IQR 7-13). On admission, 37.8% had a Lassa RT-PCR Ct value <30. From admission to end of follow-up, 120 (26.5%) had a NEWS2 ≥7, 67(13.5%) had a KDIGO ≥2, and 41 (8.0%) underwent dialysis. All of them received ribavirin therapy with a median duration of 10 days (IQR 9-13). 62 (12.2%) died (57 [13.4%] adults, 5 [6.0%] children. The median delay between admission and death was 3 days (IQR 1-6). The following characteristics on admission were independently associated to mortality: age ≥ 45 years (adjusted Odds Ratio [aOR] 16.30 [95%CI 5.31-50.30]), NEWS2 ≥7 (aOR 4.79 [95%CI 1.75-13.10]), KDIGO ≥2 (aOR 7.52 [95%CI 2.66-21.20]), ALAT ≥ 3 times the upper limit of normal range (aOR 4.96 [95%CI 1.69- 14.60]), a Lassa RT-PCR Ct value <30 (aOR 4.65 [95%CI 1.50-14.50]). Those results will be helpful for the conception of future therapeutic clinical trials as well as for updating existing management guidelines. The framework of this cohort also gave us the opportunity to describe an unusual presentation of the disease, namely delayed paraparesis. This original observation add to the evolving knowledge regarding the spectrum of Lassa fever-related neurological manifestations.Two complementary studies are nested in the LASCOPE cohort, concerning the pharmacokinetics of ribavirin, as it is used for the treatment of Lassa fever, as well as the pathophysiology of cardiovascular dysfunction that can occur during Lassa fever. Inclusions in these nested studies is still ongoing.Finally, an upcoming phase II clinical trial evaluating the pharmacokinetics, security and tolerability of a novel antiviral drug, favipiravir, for the treatment of Lassa fever is currently being prepared in two Nigerian sites, including the one we are collaborating with.
dc.language.isofr
dc.subjectFièvre de Lassa
dc.subjectFièvre virale hémorragique
dc.subjectHépatite
dc.subjectInsuffisance rénale aiguë
dc.subjectGrossesse
dc.subject.enLassa fever
dc.subject.enViral hemorragic fever
dc.subject.enHepatitis
dc.subject.enAcute kidney injury
dc.subject.enPregnancy
dc.titleAspects cliniques, biologiques et pronostiques de la fièvre de Lassa en contexte endémo-épidémique en Afrique de l’Ouest : exemple du Nigeria
dc.title.enClinical, biological and prognostic aspects of acute Lassa fever in an endemo-epidemic context in Western Africa : the case of Nigeria
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentLafon, Marie-Edith
bordeaux.hal.laboratoriesBordeaux population Health
bordeaux.type.institutionBordeaux
bordeaux.thesis.disciplineSanté publique Epidémiologie
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale Sociétés, politique, santé publique (Bordeaux)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2020BORD0254
dc.contributor.rapporteurBottieau, Emmanuel
dc.contributor.rapporteurLamballerie, Xavier de
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&amp;rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&amp;rft.title=Aspects%20cliniques,%20biologiques%20et%20pronostiques%20de%20la%20fi%C3%A8vre%20de%20Lassa%20en%20contexte%20end%C3%A9mo-%C3%A9pid%C3%A9mique%20en%20Afrique%20de%20l%E2%&amp;rft.atitle=Aspects%20cliniques,%20biologiques%20et%20pronostiques%20de%20la%20fi%C3%A8vre%20de%20Lassa%20en%20contexte%20end%C3%A9mo-%C3%A9pid%C3%A9mique%20en%20Afrique%20de%20l%E2&amp;rft.au=DUVIGNAUD,%20Alexandre&amp;rft.genre=unknown


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