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dc.contributor.advisorColin, Thierry
dc.contributor.advisorPoignard, Clair
dc.contributor.authorLEGUEBE, Michael
dc.contributor.otherGibou, Frederic
dc.contributor.otherMir, Lluis Maria
dc.date2014-09-22
dc.identifier.urihttp://www.theses.fr/2014BORD0169/abes
dc.identifier.urihttps://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01148925
dc.identifier.nnt2014BORD0169
dc.description.abstractLa perméabilisation des cellules à l’aide d’impulsions électriques intenses, appelée électroperméabilisation, est un phénomène biologique impliqué dans des thérapies anticancéreuses récentes. Elle permet, par exemple, d’améliorer l’efficacité d’une chimiothérapie en diminuant les effets secondaires, d’effectuer des transferts de gènes, ou encore de procéder à l’ablation de tumeurs. Les mécanismes de l’électroperméabilisation restent cependant encore méconnus, et l’hypothèse majoritairement admise par la communauté de formation de pores à la surface des membranes cellulaires est en contradiction avec certains résultats expérimentaux.Le travail de modélisation proposé dans cette thèse est basé sur une approche différente des modèles d’électroporation existants. Au lieu de proposer des lois sur les propriétés des membranes à partir d’hypothèses à l’échelle moléculaire, nous établissons des lois ad hoc pour les décrire, en se basant uniquement sur les informations expérimentales disponibles. Aussi, afin de rester au plus prèsde ces dernières et faciliter la phase de calibration à venir, nous avons ajouté un modèle de transport et de diffusion de molécules dans la cellule. Une autre spécificité de notre modèle est que nous faisons la distinction entre l’état conducteur et l’état perméable des membranes.Des méthodes numériques spécifiques ainsi qu’un code en 3D et parallèle en C++ ont été écrits et validés pour résoudre les équations aux dérivées partielles de ces différents modèles. Nous validons le travail de modélisation en montrant que les simulations reproduisent qualitativement les comportements observés in vitro.
dc.description.abstractEnCell permeabilization by intense electric pulses, called electropermeabilization, is a biological phenomenon involved in recent anticancer therapies. It allows, for example, to increase the efficacy of chemotherapies still reducing their side effects, to improve gene transfer, or to proceed tumor ablation. However, mechanisms of electropermeabilization are not clearly explained yet, and the mostly adopted hypothesis of the formation of pores at the membrane surface is in contradiction with several experimental results.This thesis modeling work is based on a different approach than existing electroporation models. Instead of deriving equations on membranes properties from hypothesis at the molecular scale, we prefer to write ad hoc laws to describe them, based on available experimental data only. Moreover, to be as close as possible to these data, and to ease the forthcoming work of parameter calibration, we added to our model equations of transport and diffusion of molecules in the cell. Another important feature of our model is that we differentiate the conductive state of membranes from their permeable state.Numerical methods, as well as a 3D parallel C++ code were written and validated in order to solve the partial differential equations of our models. The modeling work was validated by showing qualitative match between our simulations and the behaviours that are observed in vitro
dc.language.isofr
dc.subjectÉlectroperméabilisation
dc.subjectDiffusion surfacique discrète
dc.subjectMéthodes numériques sur grille cartésienne
dc.subjectÉquations aux dérivées partielles
dc.subjectCellules
dc.subject.enElectropermeabilization
dc.subject.enCells
dc.subject.enPartial differential equations
dc.subject.enNumerical methods on cartesian grid
dc.subject.enDiscrete surface diffusion
dc.titleModélisation de l'électroperméabilisation à l'échelle cellulaire
dc.title.enCell electropermeabilization modeling
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentKavian, Otared
bordeaux.hal.laboratoriesInstitut de mathématiques de Bordeaux
bordeaux.hal.laboratoriesInstitut national de recherche en informatique et en automatique (France). Centre de recherche Bordeaux - Sud-Ouest
bordeaux.type.institutionBordeaux
bordeaux.thesis.disciplineMathématiques appliquées et calcul scientifique
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale de mathématiques et informatique (Talence, Gironde)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2014BORD0169
dc.contributor.rapporteurHubert, Florence
dc.contributor.rapporteurMaury, Bertrand
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=Mod%C3%A9lisation%20de%20l'%C3%A9lectroperm%C3%A9abilisation%20%C3%A0%20l'%C3%A9chelle%20cellulaire&rft.atitle=Mod%C3%A9lisation%20de%20l'%C3%A9lectroperm%C3%A9abilisation%20%C3%A0%20l'%C3%A9chelle%20cellulaire&rft.au=LEGUEBE,%20Michael&rft.genre=unknown


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