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dc.contributor.advisorDubois, Véronique
dc.contributor.advisorNordmann, Patrice
dc.contributor.authorJAYOL, Aurélie
dc.date2018-10-18
dc.identifier.urihttp://www.theses.fr/2018BORD0179/abes
dc.identifier.urihttps://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02063717
dc.identifier.nnt2018BORD0179
dc.description.abstractLes entérobactéries productrices de carbapénèmases peuvent être responsables d’impasses thérapeutiques puisque ces souches sont multirésistantes aux antibiotiques. La colistine, un antibiotique de la famille des polymyxines, fait partie des molécules de derniers recours potentiellement utilisables pour le traitement des patients infectés par ces souches. Son utilisation est ainsi en augmentation constante mais des résistances émergent.Ce travail a contribué à l’amélioration du diagnostic de la résistance à la colistine par le développement de deux nouveaux outils diagnostiques : un test rapide, le Rapid Polymyxin NP test et un milieu de culture sélectif, la gélose SuperPolymyxin. Il a permis d’identifier de nouvelles mutations chromosomiques au sein des gènes pmrA, pmrB, phoP, phoQ, mgrB et crrB responsables de l’acquisition de résistances et d’hétérorésistance à la colistine chez K. pneumoniae et K. oxytoca. Il a révélé que les mutations chromosomiques et les résistances plasmidiques étaient additionnelles et pouvaient entraîner l’acquisition d’un haut niveau de résistance à la colistine chez E. coli. Il a permis d’identifier une épidémie de souches de K. pneumoniae productrices de la carbapénèmase OXA-48 et résistantes à la colistine en France en 2014. Il a démontré que Hafnia était un genre d’entérobactéries présentant une résistance naturelle de bas niveau à la colistine. Enfin, il a permis de proposer une option thérapeutique, le ceftazidime/avibactam en association ou non avec l’aztréonam, pour traiter les patients infectés par les souches de K. pneumoniae productrices de carbapénèmases et résistantes à la colistine.Ce travail a ainsi contribué à améliorer les connaissances sur la résistance à la colistine chez les BGN au niveau du diagnostic, des mécanismes de résistance acquis, des résistances naturelles, et de l’épidémiologie et a permis de proposer des combinaisons d’antibiotiques actives in vitro sur les souches de K. pneumoniae productrices de carbapénèmases et résistantes à la colistine.
dc.description.abstractEnCarbapenemase-producing Enterobacteriaceae may be responsible for therapeutic impasses since these strains are multidrug-resistant. Colistin, an antibiotic of the polymyxin family, is one of the last-resort molecules potentially usable for the treatment of patients infected with these strains. Its use is thus constantly increasing but resistances emerge.This work contributed to improve the diagnosis of colistin resistance by developing two new diagnostic tools: a rapid test, the Rapid Polymyxin NP test and a selective culture medium, the SuperPolymyxin agar. It identified new chromosomal mutations within the pmrA, pmrB, phoP, phoQ, mgrB and crrB genes responsible for the acquisition of colistin resistance and heteroresistance in K. pneumoniae and K. oxytoca. It revealed that chromosomal mutations and plasmid resistance were additional and could lead to the acquisition of a high level of colistin resistance in E. coli. It identified an outbreak caused by colistin-resistant OXA-48-producing K. pneumoniae strains in France in 2014. It demonstrated that Hafnia was a genus of enterobacteria with low-level intrinsic resistance to colistin. Finally, it suggested a therapeutic option, the ceftazidime / avibactam in combination or not with aztreonam, to treat patients infected with colistin-resistant and carbapenemase-producing K. pneumoniae.This work has significantly contributed to improve the knowledge of colistin resistance in Gram negatives in diagnostic, in characterization of acquired or intrinsic resistance mechanisms, and in epidemiology.
dc.language.isofr
dc.subjectColistine
dc.subjectPolymyxine
dc.subjectMécanismes de résistance
dc.subjectTest rapide
dc.subjectMilieu de screening
dc.subjectÉpidémiologie
dc.subjectEntérobactéries
dc.subjectBacilles Gram négatif
dc.subject.enColistin
dc.subject.enPolymyxin
dc.subject.enMechanisms of resistance
dc.subject.enRapid test
dc.subject.enScreening medium
dc.subject.enEpidemiology
dc.subject.enEnterobacteriaceae
dc.subject.enGram negative rods
dc.titleRésistance à la colistine chez les bacilles Gram négatif
dc.title.enResistance to colistin in Gram negative rods
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentRuegg, Curzio
bordeaux.hal.laboratoriesMicrobiologie fondamentale et pathogénicité (Bordeaux)
bordeaux.type.institutionBordeaux
bordeaux.type.institutionUniversité de Fribourg (Suisse)
bordeaux.thesis.disciplineMicrobiologie -immunologie
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale Sciences de la vie et de la santé (Bordeaux)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2018BORD0179
dc.contributor.rapporteurPlésiat, Patrick
dc.contributor.rapporteurPerreten, Vincent
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=R%C3%A9sistance%20%C3%A0%20la%20colistine%20chez%20les%20bacilles%20Gram%20n%C3%A9gatif&rft.atitle=R%C3%A9sistance%20%C3%A0%20la%20colistine%20chez%20les%20bacilles%20Gram%20n%C3%A9gatif&rft.au=JAYOL,%20Aur%C3%A9lie&rft.genre=unknown


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