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Elusive tropical forest canopy diversity revealed through environmental DNA contained in rainwater

hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorZINGER, Lucie
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorBENOISTON, Anne-Sophie
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorCUENOT, Yves
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorLEROY, Céline
hal.structure.identifierEcologie des forêts de Guyane [UMR ECOFOG]
dc.contributor.authorLOUISANNA, Eliane
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorMOREAU, Lucie
hal.structure.identifierEcologie des forêts de Guyane [UMR ECOFOG]
dc.contributor.authorPETITCLERC, Frédéric
hal.structure.identifierEcologie des forêts de Guyane [UMR ECOFOG]
dc.contributor.authorPIATSCHECK, Finn
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorORIVEL, Jérôme
hal.structure.identifierOffice français de la biodiversité [OFB]
hal.structure.identifierEcologie des forêts de Guyane [UMR ECOFOG]
hal.structure.identifierService conservation et gestion des espèces à enjeux [OFB SEE]
dc.contributor.authorRICHARD-HANSEN, Cécile
hal.structure.identifierOffice français de la biodiversité [OFB]
dc.contributor.authorHANSEN-CHAFFARD, Lou
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorSUESCUN, Uxue
hal.structure.identifierEcologie des forêts de Guyane [UMR ECOFOG]
dc.contributor.authorTROISPOUX, Valérie
hal.structure.identifierLaboratoire d'Ecologie Alpine [LECA]
dc.contributor.authorBOYER, Frédéric
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorCHAVE, Jérôme
hal.structure.identifierCentre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive [CEFE]
dc.contributor.authorDECAËNS, Thibaud
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorFOUQUET, Antoine
hal.structure.identifierLEHNA - Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés [équipe BAH] [LEHNA BAH]
hal.structure.identifierLEHNA - Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés [équipe E3S] [LEHNA E3S]
dc.contributor.authorPANSU, Johan
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorRAYNAUD, Jérémy
hal.structure.identifierInstitut de Systématique, Evolution, Biodiversité [ISYEB]
hal.structure.identifierMuséum national d'Histoire naturelle [MNHN]
dc.contributor.authorROUGERIE, Rodolphe
hal.structure.identifierInstitut de Systématique, Evolution, Biodiversité [ISYEB]
dc.contributor.authorSIRE, Lucas
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorSCHIMANN, Heidy
hal.structure.identifierLaboratoire d'Ecologie Alpine [LECA]
dc.contributor.authorTABERLET, Pierre
hal.structure.identifierCentre de Recherche sur la Biodiversité et l'Environnement [CRBE]
dc.contributor.authorIRIBAR, Amaia
dc.date.issued2025
dc.identifier.issn2375-2548
dc.description.abstractEnExploring the biodiversity hidden in tropical rainforests canopies represents a major frontier in biodiversity research yet remains challenging. Environmental DNA (eDNA) can revolutionize this field as it did already in various ecosystems. Here, we test the hypothesis that eDNA contained in canopy throughfall could be used to monitor this elusive diversity and detect anthropogenic disturbance. Using custom-made, low-cost rain collectors, we sampled rainwash eDNA in a mature Amazonian forest and a nearby tree plantation. We successfully detected eDNA from tropical woody and epiphyte plants, vertebrates (mammals, birds, and amphibians), and insects (e.g., mosquitoes, ants, and beetles). The taxonomic composition and diversity reflected disturbance, with significantly lower diversity in the plantation. Crucially, rainwash eDNA integrated biodiversity over a 10-day period in passive collectors and provided a local signature. This approach has thus potential for establishing a cost-effective monitoring system for tropical moist forest canopies, applicable in impact assessments and sustainable management.
dc.description.sponsorshipCEnter of the study of Biodiversity in Amazonia
dc.description.sponsorshipTowards a Unified theory of biotic Interactions: the roLe of environmental
dc.language.isoen
dc.publisherAmerican Association for the Advancement of Science (AAAS)
dc.title.enElusive tropical forest canopy diversity revealed through environmental DNA contained in rainwater
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.1126/sciadv.adx4909
dc.subject.halSciences de l'environnement/Biodiversité et Ecologie
dc.subject.halSciences de l'environnement/Ingénierie de l'environnement
bordeaux.journalScience Advances
bordeaux.pageeadx4909
bordeaux.volume11
bordeaux.issue33
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-05220607
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceInternationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-05220607v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.jtitle=Science%20Advances&rft.date=2025&rft.volume=11&rft.issue=33&rft.spage=eadx4909&rft.epage=eadx4909&rft.eissn=2375-2548&rft.issn=2375-2548&rft.au=ZINGER,%20Lucie&BENOISTON,%20Anne-Sophie&CUENOT,%20Yves&LEROY,%20C%C3%A9line&LOUISANNA,%20Eliane&rft.genre=article


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