Potentiels impacts de l'activité des cable bacteria sur les foraminifères benthiques: implications pour leurs interprétations comme bioindicateurs ou paléoproxies

Abstract

Les foraminifères à test dur sont des protistes capables de construire une coquille carbonatée ou agglutinée (appelée "test"). Nous étudions ici l'impact de l'acidification des sédiments sur la préservation des tests carbonatés. Pour cette étude, des carottes de sédiments ont été prélevées dans l'estuaire macrotidal d'Auray, situé sur la côte atlantique française. Les foraminifères vivants et morts ont été quantifiés jusqu'à 5 cm de profondeur et différenciés à l'aide du biomarqueur vital Cell-Tracker™ Green. Les profils de pH et d'oxygène combinés à la réaction en chaîne par polymérase quantitative (qPCR) ont suggéré que les cable bacteria étaient très probablement à l'origine du processus d'acidification. Les cable bacteria (CB) sont des bactéries filamenteuses couplant l'oxydation des sulfures à la réduction de l'oxygène sur des distances centimétriques, générant un fort gradient de pH dans les premiers centimètres du sédiment qui pourrait affecter les microhabitats occupés par les foraminifères benthiques. Sur deux vasières intertidales différentes, des densités volumétriques de filaments ont été estimées. Elles étaient comparables à celles observées dans la littérature pour les environnements côtiers, avec respectivement 7,4 ± 0,4 et 74,4 ± 5,0 m.cm-3 de sédiment. Une acidification très contrastée des sédiments (de faible à très intense) a été décrite de 1,0 à 2,4 ΔpH, et elle semble conduire à différents stades de dissolution du test carbonaté des foraminifères, depuis des tests intacts jusqu'à des tests entièrement dissous révélant la membrane organique. L'échelle de dissolution est basée sur des observations de spécimens vivants d'Ammonia spp. et de Haynesina germanica sous micro électronique à balayage. En outre, les assemblages de foraminifères morts ont montré une forte perte de test carbonaté et une accumulation des membranes organiques avec la profondeur sous un faible pH, entravant la préservation du test dans les sédiments profonds. Ces changements dans les assemblages de foraminifères vivants et morts suggèrent que les cable bacteria doivent être prises en compte dans les études environnementales ou historiques utilisant les foraminifères comme bioindicateurs ou proxies paléoenvironnementaux.