Détermination des volumes cellulaires et subcellulaires par analyse d’images de microscopie : Comment estimer la vitessede croissance de cellules du fruit ?
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | ANDRIEU, Marie-Hélène | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
hal.structure.identifier | Bordeaux Imaging Center [BIC] | |
dc.contributor.author | CHENICLET, Catherine | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | DIEUAIDE-NOUBHANI, Martine | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | BEAUVOIT, Bertrand | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | GIBON, Yves | |
dc.date.issued | 2023-12-01 | |
dc.identifier.issn | 2823-2283 | |
dc.description.abstract | L’estimation des volumes cellulaires et des proportions subcellulaires est nécessaire pour l’étude des flux métaboliques dans le fruit au cours du développement. L’analyse d’images de microscopie optique avec le logiciel libre « Image J » nous a permis de collecter les grandeurs utiles au paramétrage du modèle de cellulede fruit décrit comme étant de forme ellipsoïdale. Les estimations de volumes obtenues pour différents stades de développement du fruit ont permis d’obtenir une cinétique de croissance de la cellule moyenne ainsi que de ses compartiments majeurs. L’ajustement des données mesurées à une fonction mathématique adaptée a permis de calculer la vitesse de croissance cellulaire au cours du temps. | |
dc.description.abstractEn | The estimation of cell volumes and subcellular proportions is necessary for studying metabolic fluxes in fruit during its development. By analyzing optical microscopy images using the freeware "Image J", we were able to collect the data needed to parameterize a fruit cell model described as ellipsoidal in shape. The volume estimates obtained for different stages of fruit development enabled us to obtain growth kinetics for the average cell and its major compartments. By fitting the measured data to an appropriate mathematical function, we were able to calculate cell growth rate over time. | |
dc.language.iso | fr | |
dc.publisher | INRAE | |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-sa/ | |
dc.subject | Volumes cellulaires | |
dc.subject | compartimentation subcellulaire | |
dc.subject | vacuole | |
dc.subject | cytoplasme | |
dc.subject | paroi | |
dc.subject | microscopie optique | |
dc.subject | analyse d'image | |
dc.subject | péricarpe de fruit | |
dc.subject | modèle | |
dc.subject | estimation | |
dc.subject | développement du fruit | |
dc.subject.en | Cell volumes | |
dc.subject.en | subcellular compartmentalization | |
dc.subject.en | vacuole | |
dc.subject.en | cytoplasm | |
dc.subject.en | cell wall | |
dc.subject.en | light microscopy | |
dc.subject.en | image analysis | |
dc.subject.en | fruit pericarp | |
dc.subject.en | model | |
dc.subject.en | estimation | |
dc.subject.en | fruit development. | |
dc.title | Détermination des volumes cellulaires et subcellulaires par analyse d’images de microscopie : Comment estimer la vitessede croissance de cellules du fruit ? | |
dc.title.en | Determining cellular and subcellular volumes by analyzing microscope images: How can the speed of fruit cell growth be estimated? | |
dc.type | Article de revue | |
dc.identifier.doi | 10.17180/novae-2023-NO-art14 | |
dc.subject.hal | Sciences de l'environnement | |
dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio] | |
dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale | |
bordeaux.journal | NOV'AE | |
bordeaux.page | 1-15 | |
bordeaux.issue | 14 | |
bordeaux.peerReviewed | oui | |
hal.identifier | hal-04575735 | |
hal.version | 1 | |
hal.popular | non | |
hal.audience | Nationale | |
hal.origin.link | https://hal.archives-ouvertes.fr//hal-04575735v1 | |
bordeaux.COinS | ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=D%C3%A9termination%20des%20volumes%20cellulaires%20et%20subcellulaires%20par%20analyse%20d%E2%80%99images%20de%20microscopie%20:%20Comment%20estimer%20la%20vitessede%20cr&rft.atitle=D%C3%A9termination%20des%20volumes%20cellulaires%20et%20subcellulaires%20par%20analyse%20d%E2%80%99images%20de%20microscopie%20:%20Comment%20estimer%20la%20vitessede%20c&rft.jtitle=NOV'AE&rft.date=2023-12-01&rft.issue=14&rft.spage=1-15&rft.epage=1-15&rft.eissn=2823-2283&rft.issn=2823-2283&rft.au=ANDRIEU,%20Marie-H%C3%A9l%C3%A8ne&CHENICLET,%20Catherine&DIEUAIDE-NOUBHANI,%20Martine&BEAUVOIT,%20Bertrand&GIBON,%20Yves&rft.genre=article |
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