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hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorANDRIEU, Marie-Hélène
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
hal.structure.identifierBordeaux Imaging Center [BIC]
dc.contributor.authorCHENICLET, Catherine
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorDIEUAIDE-NOUBHANI, Martine
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorBEAUVOIT, Bertrand
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorGIBON, Yves
dc.date.issued2023-12-01
dc.identifier.issn2823-2283
dc.description.abstractL’estimation des volumes cellulaires et des proportions subcellulaires est nécessaire pour l’étude des flux métaboliques dans le fruit au cours du développement. L’analyse d’images de microscopie optique avec le logiciel libre « Image J » nous a permis de collecter les grandeurs utiles au paramétrage du modèle de cellulede fruit décrit comme étant de forme ellipsoïdale. Les estimations de volumes obtenues pour différents stades de développement du fruit ont permis d’obtenir une cinétique de croissance de la cellule moyenne ainsi que de ses compartiments majeurs. L’ajustement des données mesurées à une fonction mathématique adaptée a permis de calculer la vitesse de croissance cellulaire au cours du temps.
dc.description.abstractEnThe estimation of cell volumes and subcellular proportions is necessary for studying metabolic fluxes in fruit during its development. By analyzing optical microscopy images using the freeware "Image J", we were able to collect the data needed to parameterize a fruit cell model described as ellipsoidal in shape. The volume estimates obtained for different stages of fruit development enabled us to obtain growth kinetics for the average cell and its major compartments. By fitting the measured data to an appropriate mathematical function, we were able to calculate cell growth rate over time.
dc.language.isofr
dc.publisherINRAE
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/
dc.subjectVolumes cellulaires
dc.subjectcompartimentation subcellulaire
dc.subjectvacuole
dc.subjectcytoplasme
dc.subjectparoi
dc.subjectmicroscopie optique
dc.subjectanalyse d'image
dc.subjectpéricarpe de fruit
dc.subjectmodèle
dc.subjectestimation
dc.subjectdéveloppement du fruit
dc.subject.enCell volumes
dc.subject.ensubcellular compartmentalization
dc.subject.envacuole
dc.subject.encytoplasm
dc.subject.encell wall
dc.subject.enlight microscopy
dc.subject.enimage analysis
dc.subject.enfruit pericarp
dc.subject.enmodel
dc.subject.enestimation
dc.subject.enfruit development.
dc.titleDétermination des volumes cellulaires et subcellulaires par analyse d’images de microscopie : Comment estimer la vitessede croissance de cellules du fruit ?
dc.title.enDetermining cellular and subcellular volumes by analyzing microscope images: How can the speed of fruit cell growth be estimated?
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.17180/novae-2023-NO-art14
dc.subject.halSciences de l'environnement
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale
bordeaux.journalNOV'AE
bordeaux.page1-15
bordeaux.issue14
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-04575735
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceNationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-04575735v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=D%C3%A9termination%20des%20volumes%20cellulaires%20et%20subcellulaires%20par%20analyse%20d%E2%80%99images%20de%20microscopie%20:%20Comment%20estimer%20la%20vitessede%20cr&rft.atitle=D%C3%A9termination%20des%20volumes%20cellulaires%20et%20subcellulaires%20par%20analyse%20d%E2%80%99images%20de%20microscopie%20:%20Comment%20estimer%20la%20vitessede%20c&rft.jtitle=NOV'AE&rft.date=2023-12-01&rft.issue=14&rft.spage=1-15&rft.epage=1-15&rft.eissn=2823-2283&rft.issn=2823-2283&rft.au=ANDRIEU,%20Marie-H%C3%A9l%C3%A8ne&CHENICLET,%20Catherine&DIEUAIDE-NOUBHANI,%20Martine&BEAUVOIT,%20Bertrand&GIBON,%20Yves&rft.genre=article


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