Utilisation du machine learning sur des données prospectives de vie réelle pour le développement d’un modèle de prédiction post opératoire du risque de récidive du cancer du rein localisé ou localement avancé (Étude UroCCR 120)
dc.rights.license | authentification | en_US |
dc.contributor.advisor | BERNHARD, Jean-Christophe | |
dc.contributor.author | MARGUE, Gaëlle | |
dc.date | 2023-10-09 | |
dc.date.accessioned | 2024-04-17T12:29:12Z | |
dc.date.available | 2024-04-17T12:29:12Z | |
dc.identifier.uri | https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/199202 | |
dc.description.abstract | Le carcinome à cellules rénales (CCR) est le plus souvent diagnostiqué à un stade localisé où la chirurgie est le traitement standard. Les scores pronostiques existants offrent des performances prédictives modérées, rendant difficile l'établissement de recommandations de suivi en post opératoire et la sélection des patients candidats à une thérapie adjuvante. L'objectif de cette étude est de développer un modèle de prédiction individuelle postopératoire de la survie sans maladie (SSM) en utilisant le "machine learning" (ML). Méthode : à partir de la base de données du réseau français de recherche sur le cancer du rein UroCCR, une cohorte de patients opérés d'un CCR (pT0-4, N0-1, M0) entre mai 2000 et janvier 2020 a été analysée. Les centres participants ont été assignés aléatoirement à la cohorte entrainement ou test avec un ratio de patients de 2:1. Plusieurs modèles de ML ont été entraînés sur l'ensemble des données d'entraînement. L'AUC intégrée (iAUC) sur la période de suivi (6, 60 mois après la chirurgie) a été choisie comme métrique d'optimisation. Les performances du meilleur modèle de ML ont ensuite été évaluées sur les données de test et comparées aux scores de risque habituels. Résultats : au total, 3372 patients ont été inclus et 480 d'entre eux ont présenté un événement au cours du suivi (médiane de 30 mois). Les meilleurs résultats de prédiction de la SSM ont été obtenus en utilisant une combinaison de modèles de Cox PH intégrant 24 variables avec une iAUC de 0.81 [IC95% 0.77 - 0.85]. Ce modèle a surpassé les performances prédictives de la plupart des scores de risque habituels tout en traitant les données incomplètes. Enfin, les patients ont été stratifiés en quatre groupes de pronostics distincts avec une bonne discrimination. Conclusion : notre étude suggère que le ML appliqué aux données de patients opérés d'un CCR offre de bonnes prédictions individuelles de la SSM par rapport aux scores pronostiques habituels. | |
dc.description.abstractEn | Renal cell carcinoma (RCC) is most often diagnosed at a localized stage where surgery is the standard of care. Existing prognostic scores offer moderate predictive performance leading to difficulties in establishing follow-up recommendations after surgery and selecting patients for adjuvant therapy. Our objective is to develop a model for individual postoperative disease-free survival (DFS) prediction using machine learning (ML). Methods: using the French kidney cancer research network database UroCCR, we analyzed a cohort of surgically treated RCC patients (pTany, Nany, M0) from May 2000 to January 2020. Participating sites were randomly assigned to the training or testing cohort with a 2:1 ratio of patients. Several ML models were trained on the training dataset. Integrated AUC (iAUC) over the time interval (6, 60 months after surgery) was chosen as optimization metric. The predictive performance of the best ML model was then evaluated on the test dataset and compared with usual risk scores. Findings: in total, 3372 patients were included, and 480 patients experienced an event over the follow-up (median 30 months). The best results in DFS prediction were obtained using Cox PH models including 24 variables with an iAUC of 0·81 [IC95% 0·77 – 0·85]. It outperformed the predictive performance of most usual risk scores while handling incomplete data in predictors. Finally, patients were stratified into four distinct prognostic categories with good discrimination. Conclusion: our study suggests that ML applied to data from patients undergoing surgery for RCC can provide good individual DFS prediction compared to usual prognostic scores. | |
dc.language.iso | FR | en_US |
dc.subject | Carcinome rénal | |
dc.subject | Chirurgie | |
dc.subject | Machine learning | |
dc.subject | Prédiction de la récidive | |
dc.subject.en | Renal cell carcinoma | |
dc.subject.en | Surgery | |
dc.subject.en | Machine learning | |
dc.subject.en | Recurrence prediction | |
dc.title | Utilisation du machine learning sur des données prospectives de vie réelle pour le développement d’un modèle de prédiction post opératoire du risque de récidive du cancer du rein localisé ou localement avancé (Étude UroCCR 120) | |
dc.title.en | Machine learning model on real world prospective data for individual prediction of postoperative kidney cancer recurrence (UroPredict - UroCCR study 120) | |
dc.type | Thèse d'exercice | en_US |
dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie | en_US |
bordeaux.hal.laboratories | Thèses d’exercice de l’Université de Bordeaux | en_US |
bordeaux.type.institution | Université de Bordeaux | en_US |
bordeaux.thesis.type | thèse d'exercice de médecine spécialisée | en_US |
bordeaux.thesis.discipline | Urologie | en_US |
hal.export | false | |
dc.rights.cc | Pas de Licence CC | en_US |
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