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hal.structure.identifierModélisation et calculs pour l'électrophysiologie cardiaque [CARMEN]
hal.structure.identifierIHU-LIRYC
dc.contributor.authorDOUANLA LONTSI, Charlie
hal.structure.identifierModélisation et calculs pour l'électrophysiologie cardiaque [CARMEN]
hal.structure.identifierInstitut de Mathématiques de Bordeaux [IMB]
hal.structure.identifierIHU-LIRYC
dc.contributor.authorCOUDIÈRE, Yves
hal.structure.identifierLaboratoire de Mathématiques et de leurs Applications [Pau] [LMAP]
dc.contributor.authorPIERRE, Charles
dc.date.accessioned2024-04-04T03:06:15Z
dc.date.available2024-04-04T03:06:15Z
dc.date.created2017-10-13
dc.date.issued2018-04-25
dc.identifier.urihttps://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/193318
dc.description.abstractDans ce travail, nous analysons le recours aux solveurs exponentiels d’ordre élevé pourdes EDO raides dans le contexte de la modélisation en électrophysiologie cardiaque. Nous nousintéressons en particulier aux schémas exponentiels Adams Bashforth et Rush Larsen de l’ordre 2à 4. Ces schémas sont explicites et multi-pas. La précision et le coût de ces méthodes sont analysésnumériquement et comparés avec plusieurs schémas explicites et implicites classiques à diversordres. Cette analyse nous permet de calculer des valeurs informatives qui ont un interêt particulieren électrophysiologie cardiaque: Le temps d’activation (ta), le temps de restitution (tr) et la durée dupotentiel d’action (APD). L’étude est faite à travers le modèle ionique Beeler Reuter, spécialementconçu pour les cellules ventriculaires cardiaques. Nous montrons que malgré la raideur des équations,les schémas exponentiels permettent de faire des calculs à des pas de temps aussi grand quepour des schémas implicites. De plus pour une précision donnée, un gain significatif en terme de coûtest obtenu avec des solveurs exponentiels. Nous concluons qu’il est possible de faire des calculsprécis à des grands échelles de temps avec des schémas explicites d’ordre élevé. Ce qui est unecaractéristique très importante quand il s’agit des EDO raides et non linéaires.
dc.description.abstractEnIn this work we analyze the resort to high order exponential solvers for stiff ODEs in the context of cardiac electrophysiology modeling. The exponential Adams-Bashforth and the Rush-Larsen schemes will be considered up to order 4. These methods are explicit multistep schemes.The accuracy and the cost of these methods are numerically analyzed in this paper and benchmarked with several classical explicit and implicit schemes at various orders. This analysis has been led considering data of high particular interest in cardiac electrophysiology : the activation time ($t_a$ ), the recovery time ($t_r $) and the action potential duration ($APD$). The Beeler Reuter ionic model, especially designed for cardiac ventricular cells, has been used for this study. It is shown that, in spite of the stiffness of the considered model, exponential solvers allow computation at large time steps, as large as for implicit methods. Moreover, in terms of cost for a given accuracy, a significant gain is achieved with exponential solvers. We conclude that accurate computations at large time step are possible with explicit high order methods. This is a quite important feature when considering stiff non linear ODEs.
dc.description.sponsorshipModèles numériques haute résolution de l'électrophysiologie cardiaque - ANR-13-MONU-0004
dc.language.isoen
dc.publisherAfrican Society in Digital Science
dc.subjectschémas exponetiels
dc.subjectéquations aux dérivées ordinaires raides
dc.subjectElectrophysiologie cardiaque
dc.subjectschémas d’ordre élevé
dc.subject.enstiff ordinary differential equations
dc.subject.encardiac electrophysiology
dc.subject.enhigh order schemes
dc.subject.enExponential schemes
dc.title.enEfficient high order schemes for stiff ODEs in cardiac electrophysiology
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.46298/arima.2668
dc.subject.halMathématiques [math]/Analyse numérique [math.NA]
bordeaux.journalRevue Africaine de Recherche en Informatique et Mathématiques Appliquées
bordeaux.volumeVolume 28 - 2018 - 2019 - Mathematics for Biology and the Environment
bordeaux.hal.laboratoriesInstitut de Mathématiques de Bordeaux (IMB) - UMR 5251*
bordeaux.institutionUniversité de Bordeaux
bordeaux.institutionBordeaux INP
bordeaux.institutionCNRS
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-01406683
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceInternationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-01406683v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.jtitle=Revue%20Africaine%20de%20Recherche%20en%20Informatique%20et%20Math%C3%A9matiques%20Appliqu%C3%A9es&rft.date=2018-04-25&rft.volume=Volume%2028%20-%202018%20-%202019%20-%20Mathematics%20for%20Biology%20and%20the%20Environment&rft.au=DOUANLA%20LONTSI,%20Charlie&COUDI%C3%88RE,%20Yves&PIERRE,%20Charles&rft.genre=article


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