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hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorSOW, Mamadou Dia
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorROGIER, Odile
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
hal.structure.identifierHelixVenture
dc.contributor.authorLESUR, Isabelle
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorDAVIAUD, Christian
hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
dc.contributor.authorMARDOC, Emile
hal.structure.identifierLaboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry [LaMME]
dc.contributor.authorSANOU, Edmond
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorDUVAUX, Ludovic
hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
dc.contributor.authorCIVAN, Peter
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorDELAUNAY, Alain
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorDESCAUSES, Marie-Claude Lesage-
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorBENOIT, Vanina
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorLE-JAN, Isabelle
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorBURET, Corinne
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorBESSE, Céline
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorDURUFLÉ, Harold
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorFICHOT, Régis
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorLE PROVOST, Grégoire
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorGUICHOUX, Erwan
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorBOURY, Christophe
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorGARNIER, Abel
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorSENHAJI-RACHIK, Abdeljalil
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorJORGE, Véronique
hal.structure.identifierLaboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry [LaMME]
dc.contributor.authorAMBROISE, Christophe
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorTOST, Jörg
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorPLOMION, Christophe
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
hal.structure.identifierAmélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP]
dc.contributor.authorSEGURA, Vincent
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorMAURY, Stéphane
hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
dc.contributor.authorSALSE, Jérôme
dc.date.issued2023-07-18
dc.description.abstractEnHow perennial organisms adapt to environments is a key question in biology. To address this question, we investigated ten natural black poplar ( Populus nigra ) populations from Western Europe, a keystone forest tree of riparian ecosystems. We assessed the role of (epi)genetic regulation in driving tree species evolution and adaptation over several millions of years (macro-evolution) up to a few generations (micro-evolution). At the macro-evolution scale, polar experienced differential structural (gene loss) and regulation (expression and methylation) reprogramming between sister genomic compartments inherited from polyploidization events. More interestingly, at the micro-evolution scale, both genetic and epigenetic variations differentiate populations from different geographic origins, targeting specifically genes involved in disease resistance, immune response, hormonal and stress response that can be considered as key functions of local adaptation of long lifespan species. Moreover, genes involved in cambium formation, an important functional trait for forest trees, as well as basal functions for cell survival are constitutively expressed though methylation control. These results highlight DNA methylation as a marker of population differentiation, evolutionary adaptation to diverse ecological environments and ultimately opening the need to take epigenetic marks into account in breeding strategies, especially for woody plants.
dc.description.sponsorshipImpacts évolutif et fonctionnel de variations épigénétiques chez des arbres forestiers.
dc.language.isoen
dc.subject.enepigenetic variation
dc.subject.enDNA methylation
dc.subject.ennatural population differentiation
dc.subject.enmacro-evolution
dc.subject.enmicro-evolution
dc.subject.engene duplication
dc.subject.engene expression
dc.subject.encambium
dc.title.enEpigenetic Variation in Tree Evolution: a case study in black poplar (Populus nigra)
dc.typeDocument de travail - Pré-publication
dc.identifier.doi10.1101/2023.07.16.549253
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biodiversité/Evolution [q-bio.PE]
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale/Amélioration des plantes
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Ecologie, Environnement/Ecosystèmes
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique des plantes
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Sciences agricoles/Sylviculture, foresterie
hal.identifierhal-04170410
hal.version1
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-04170410v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.date=2023-07-18&rft.au=SOW,%20Mamadou%20Dia&ROGIER,%20Odile&LESUR,%20Isabelle&DAVIAUD,%20Christian&MARDOC,%20Emile&rft.genre=preprint


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