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Metagenomic-based impact study of transgenic grapevine rootstock on its associated virome and soil bacteriome

hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorHILY, Jean-Michel
hal.structure.identifierAmpère, Département Bioingénierie [BioIng]
dc.contributor.authorDEMANÈCHE, Sandrine
hal.structure.identifierUMR - Interactions Plantes Microorganismes Environnement [UMR IPME]
dc.contributor.authorPOULICARD, Nils
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorTANNIÈRES, Mélanie
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorDJENNANE, Samia
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorBEUVE, Monique
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorVIGNE, Emmanuelle
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorDEMANGEAT, Gérard
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorKOMAR, Véronique
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorGERTZ, Claude
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorMARMONIER, Aurélie
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorHEMMER, Caroline
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorVIGNERON, Sophie
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorMARAIS, Armelle
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorCANDRESSE, Thierry
hal.structure.identifierAmpère, Département Bioingénierie [BioIng]
dc.contributor.authorSIMONET, Pascal
hal.structure.identifierSanté de la vigne et qualité du vin [SVQV]
dc.contributor.authorLEMAIRE, Olivier
dc.date.issued2017-08-09
dc.identifier.issn1467-7644
dc.description.abstractEnFor some crops, the only possible approach to gain a specific trait requires genome modification. The development of virus-resistant transgenic plants based on the pathogen-derived resistance strategy has been a success story for over three decades. However, potential risks associated with the technology, such as horizontal gene transfer (HGT) of any part of the transgene to an existing gene pool, have been raised. Here, we report no evidence of any undesirable impacts of genetically modified (GM) grapevine rootstock on its biotic environment. Using state of the art metagenomics, we analysed two compartments in depth, the targeted Grapevine fanleaf virus (GFLV) populations and nontargeted root-associated microbiota. Our results reveal no statistically significant differences in the genetic diversity of bacteria that can be linked to the GM trait. In addition, no novel virus or bacteria recombinants of biosafety concern can be associated with transgenic grapevine rootstocks cultivated in commercial vineyard soil under greenhouse conditions for over 6 years.
dc.description.sponsorshipAnalyse de l'impact de la culture de plantes génétiquement modifiées sur la microflore associée par une approche métagénomique à haut débit - ANR-11-CESA-0005
dc.language.isoen
dc.publisherWiley
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/
dc.subjectEnvironmental microbiology
dc.subjectmetagenomics
dc.subject.engrapevine
dc.subject.ensafety and regulatory affairs
dc.subject.entransgenic rootstock
dc.title.enMetagenomic-based impact study of transgenic grapevine rootstock on its associated virome and soil bacteriome
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.1111/pbi.12761
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]
bordeaux.journalPlant Biotechnology Journal
bordeaux.page208-220
bordeaux.volume16
bordeaux.issue1
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-01588179
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceInternationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-01588179v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.jtitle=Plant%20Biotechnology%20Journal&rft.date=2017-08-09&rft.volume=16&rft.issue=1&rft.spage=208-220&rft.epage=208-220&rft.eissn=1467-7644&rft.issn=1467-7644&rft.au=HILY,%20Jean-Michel&DEMAN%C3%88CHE,%20Sandrine&POULICARD,%20Nils&TANNI%C3%88RES,%20M%C3%A9lanie&DJENNANE,%20Samia&rft.genre=article


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