Caractérisation moléculaire du Yam virus X (YVX) et du Yam necrosis virus (YNV), deux nouveaux virus des genres Potexvirus et Sadwavirus infectant les ignames en Guadeloupe, et mise au point d’outils de diagnostic
hal.structure.identifier | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP] | |
dc.contributor.author | ACINA-MAMBOLE, Isabelle | |
hal.structure.identifier | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP] | |
dc.contributor.author | BONHEUR, Lydiane | |
hal.structure.identifier | Agrosystèmes tropicaux [ASTRO] | |
dc.contributor.author | ANZALA, Fabiola | |
hal.structure.identifier | Agrosystèmes tropicaux [ASTRO] | |
dc.contributor.author | GOMEZ, Rose-Marie | |
hal.structure.identifier | Agrosystèmes tropicaux [ASTRO] | |
dc.contributor.author | LANGE, David | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | FAURE, Chantal | |
hal.structure.identifier | Biologie et Génétique des interactions Plantes-parasites pour la Protection Intégrée | |
hal.structure.identifier | Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite [UMR BGPI] | |
dc.contributor.author | FILLOUX, Denis | |
hal.structure.identifier | Biologie et Génétique des interactions Plantes-parasites pour la Protection Intégrée | |
hal.structure.identifier | Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite [UMR BGPI] | |
dc.contributor.author | ROUMAGNAC, Philippe | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | MARAIS, Armelle | |
hal.structure.identifier | Biologie du fruit et pathologie [BFP] | |
dc.contributor.author | CANDRESSE, Thierry | |
hal.structure.identifier | Agrosystèmes tropicaux [ASTRO] | |
dc.contributor.author | PAVIS, Claude | |
hal.structure.identifier | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP] | |
dc.contributor.author | TEYCHENEY, Pierre-Yves | |
dc.date.issued | 2012 | |
dc.date.conference | 2012-06-05 | |
dc.description.abstract | Les ignames (<em>Dioscorea spp.</em>) sont des ressources alimentaires économiquement et socialement importantes en Afrique, dans la Caraïbe, en Amérique du Sud et dans les îles du Pacifique. Les espèces cultivées hébergent de nombreux virus des genres potexvirus, carlavirus, badnavirus, cucumovirus, macluravirus et potyvirus, qui constituent la principale contrainte pour la conservation et la diffusion de ressources génétiques. Deux nouveaux virus appartenant aux genres <em>potexvirus</em> et <em>sadwavirus</em>, baptisés respectivement Yam virus X (YVX) et Yam necrosis virus (YNV), ont été mis en évidence par analyses in silico d’EST d’ignames. La partie 3’ du génome de chacun de ces virus a été amplifiée par 3’RACE à partir de plantes infectées et présentant des symptômes de nécrose foliaire récoltées en Guadeloupe, clonée puis séquencée. Les séquences obtenues ont permis d’établir les relations phylogéniques de ces espèces virales au sein des genres <em>potexvirus</em> et <em>sadwavirus</em>. Des amorces spécifiques de chacun de ces deux virus ont été dessinées dans la région codant l’ARN polymérase ARN dépendante (RdRp) et utilisées pour la mise au point de tests de détection moléculaire par direct binding reverse transcription PCR (DB-RT-PCR) dans des broyats de feuilles. Ces outils complètent l’arsenal disponible pour le diagnostic des virus des ignames et permettent d’entreprendre des études de prévalence du YVX et du YNV en Guadeloupe. | |
dc.language.iso | fr | |
dc.title | Caractérisation moléculaire du Yam virus X (YVX) et du Yam necrosis virus (YNV), deux nouveaux virus des genres Potexvirus et Sadwavirus infectant les ignames en Guadeloupe, et mise au point d’outils de diagnostic | |
dc.type | Autre communication scientifique (congrès sans actes - poster - séminaire...) | |
dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio] | |
dc.subject.hal | Sciences de l'environnement | |
dc.subject.hal | Sciences de l'Homme et Société | |
dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale | |
dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio]/Ingénierie des aliments | |
dc.subject.hal | Sciences de l'ingénieur [physics]/Génie des procédés | |
bordeaux.conference.title | 8. Colloque de la Société Française de Phytopathologie (SFP) | |
bordeaux.country | FR | |
bordeaux.conference.city | Paris | |
bordeaux.peerReviewed | oui | |
hal.identifier | hal-02807617 | |
hal.version | 1 | |
hal.invited | non | |
hal.conference.end | 2012-06-08 | |
hal.popular | non | |
hal.audience | Nationale | |
hal.origin.link | https://hal.archives-ouvertes.fr//hal-02807617v1 | |
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