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Epigenetic Variation in Tree Evolution: a case study in black poplar (Populus nigra)

hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorSOW, Mamadou Dia
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorROGIER, Odile
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
hal.structure.identifierHelixVenture
dc.contributor.authorLESUR, Isabelle
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorDAVIAUD, Christian
hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
dc.contributor.authorMARDOC, Emile
hal.structure.identifierLaboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry [LaMME]
dc.contributor.authorSANOU, Edmond
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorDUVAUX, Ludovic
hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
dc.contributor.authorCIVAN, Peter
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorDELAUNAY, Alain
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorDESCAUSES, Marie-Claude Lesage-
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorBENOIT, Vanina
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorLE-JAN, Isabelle
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorBURET, Corinne
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorBESSE, Céline
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorDURUFLÉ, Harold
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorFICHOT, Régis
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorLE PROVOST, Grégoire
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorGUICHOUX, Erwan
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorBOURY, Christophe
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorGARNIER, Abel
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorSENHAJI-RACHIK, Abdeljalil
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
dc.contributor.authorJORGE, Véronique
hal.structure.identifierLaboratoire de Mathématiques et Modélisation d'Evry [LaMME]
dc.contributor.authorAMBROISE, Christophe
hal.structure.identifierCentre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
dc.contributor.authorTOST, Jörg
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorPLOMION, Christophe
hal.structure.identifierBiologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt [BioForA]
hal.structure.identifierAmélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP]
dc.contributor.authorSEGURA, Vincent
hal.structure.identifierLaboratoire de Biologie des Ligneux et des Grandes Cultures [LBLGC]
dc.contributor.authorMAURY, Stéphane
hal.structure.identifierGénétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales [GDEC]
dc.contributor.authorSALSE, Jérôme
dc.date.conference2024-07-10
dc.description.abstractEnUnderstanding the forces driving species evolution is central in biology. Genetic and epigenetic variations play key roles at either short timescale, over a few hundreds of generations (micro-evolution), or over long timescale of several millions of years (macro-evolution). How the environment shapes genetic and epigenetic variations remains a central question.<br/><br/>To address this question, we investigated perennial natural populations of black poplars (Populus nigra) sampled from distinct geographic origins (France, Italy, Germany, and Netherlands) and grown in a common garden in France. We focus on cambial tissues, an important functional trait for forest trees, responsible of wood formation, in order to assess the evolutionary and functional impact of epigenetic variations at macro- (past polyploidization events) and micro- (geographical origins) scales.<br/><br/>At the macro-evolution scale, polar experienced differential structural (gene loss) and regulation (expression and methylation) reprogramming between sister genomic compartments inherited from polyploidization events. At the micro-evolution scale, both genetic and epigenetic variations differentiate populations from different geographic origins, targeting specifically genes involved in disease resistance, immune response, hormonal and stress response that can be considered as key functions of local adaptation of long lifespan species. Moreover, genes involved in cambium formation as well as in basal functions of cell development are constitutively expressed and negatively correlated with methylation level.<br/><br/>Altogether, our results highlight DNA methylation as a marker of population differentiation for long-living species and could be involved at population level with plant response to biotic and abiotic stress (R-genes, phytohormones, etc.) and at the genome level with tissue specific regulation (cambium activity, ribosome, etc.).
dc.description.sponsorshipImpacts évolutif et fonctionnel de variations épigénétiques chez des arbres forestiers. - ANR-17-CE32-0009
dc.language.isoen
dc.subject.enEpigenetic variation
dc.subject.enDNA methylation
dc.subject.ennatural population differentiation
dc.subject.enmacro-evolution
dc.subject.enmicro-evolution
dc.subject.engene duplication
dc.subject.engene expression
dc.subject.enwood formation.
dc.title.enEpigenetic Variation in Tree Evolution: a case study in black poplar (Populus nigra)
dc.typeAutre communication scientifique (congrès sans actes - poster - séminaire...)
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biodiversité/Evolution [q-bio.PE]
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale/Amélioration des plantes
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Ecologie, Environnement/Ecosystèmes
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique des plantes
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Sciences agricoles/Sylviculture, foresterie
bordeaux.page131-132
bordeaux.volumeSession VI Chromatin in transcription, replication and repair
bordeaux.issuePoster #69
bordeaux.conference.titlePlant Epigenetics (EPIPLANT/SEB 2024)
bordeaux.countryFR
bordeaux.conference.cityClermont-Ferrand
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-05056784
hal.version1
hal.invitednon
hal.proceedingsnon
hal.conference.organizerGroupement de Recherche (GDR CNRS) EPIPLANT
hal.conference.organizerSociety For Experimental Biology (SEB)
hal.conference.end2024-07-12
hal.popularnon
hal.audienceInternationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-05056784v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&amp;rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&amp;rft.volume=Session%20VI%20Chromatin%20in%20transcription,%20replication%20and%20repair&amp;rft.issue=Poster%20%2369&amp;rft.spage=131-132&amp;rft.epage=131-132&amp;rft.au=SOW,%20Mamadou%20Dia&amp;ROGIER,%20Odile&amp;LESUR,%20Isabelle&amp;DAVIAUD,%20Christian&amp;MARDOC,%20Emile&amp;rft.genre=conference


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