Pratiques intègres de publication scientifique à l’heure de la science ouverte. Note de recommandations

Abstract

La science ouverte a pour but explicite de rendre accessible à l’ensemble de la communauté scientifique, et plus largement au grand public, les connaissances produites par la recherche scientifique. Les publications qui en résultent concernent les multiples facettes de la recherche telles que les résultats, mais aussi les hypothèses, les méthodes employées ou de larges collections de données. La transparence est une des valeurs fondamentales de l’intégrité scientifique à laquelle la science ouverte peut largement contribuer en la promouvant et l’organisant. La science ouverte encourage en effet les pratiques honnêtes et rigoureuses en mettant à disposition toutes les informations sur le processus de recherche, et permet entre autres d’améliorer la reproductibilité des résultats de recherche. Elle contribue également à instaurer, restaurer, consolider la confiance dans la recherche et la sérénité des débats scientifiques. Elle permet enoutre de rendre perceptibles les débats internes essentiels à la recherche de consensus scientifique sur les questions traitées.La diffusion des connaissances par la publication scientifique est considérée comme le cœur de l’activité de tout personnel scientifique tant vis-à-vis de la communauté scientifique que de la société. Le mouvement de fond que constitue la science ouverte est venu fortement modifier les pratiques de publication : libre accès aux contenus (open access), pré-enregistrements des hypothèses et protocoles (pre-registrations, registered reports), libre accès aux rapports de reviewing par les pairs (open peer reviewing), libre accès aux données et aux codes en sont quelques exemples. La nature même du contenu des publications évolue également : certaines revues offrent désormais la possibilité de faire évaluer par les pairs et de publier des hypothèses, des données (data papers)mais aussi des codes de calcul, des « matériels et méthodes » exhaustifs et opérationnels, voire des résultats négatifs ou des réplications de résultats, ainsi que certaines étapes des processus éditoriaux. Ces (r)évolutions contribuent à renforcer les pratiques intègres de la science. INRAE, établissement engagé dans une politique de science ouverte comme il est énoncé dans son document d’orientation 2030, a formulé un ensemble de recommandations aux auteurs de publications scientifiques pour que ces dernières soient librement accessibles.L’ouverture de la science ne présente pas que des opportunités et certains risques pour l’intégrité scientifique peuvent émerger, tels que la diffusion de résultats insuffisamment validés ou la divulgation de données confidentielles (individuelles, administratives ou industrielles). Même s’il ne représente pas en soi un risque pour l’intégrité, le libre accès (open access) avec paiement par les auteurs a cependant favorisé l’émergence de maisons d’édition douteuses (souvent qualifiées de « prédatrices ») proposant en libre accès des articles qui peuvent faire l’objet de processus indigents de validation par les pairs et/ou s’appuyant sur des processus éditoriaux de qualité insuffisante. Très récemment, la mise en accès libre de systèmes d’intelligence artificielle générative présente un risque certain d’utilisation pour des pratiques frauduleuses comme la rédaction automatique, le plagiat ou la fabrication de données.Le présent document a pour objectif de fournir aux scientifiques d’INRAE impliqués dans le processus de publication scientifique quelques recommandationspour une pratique intègre de la publication dans un contexte de science ouverte, en complément du document précédemment cité . Ce texte est le fruit de la réflexion d’un groupe de travail réuni à l’initiative de la Délégation à la déontologie, l’intégrité scientifique et l’éthique des projets de recherche, conjointement à la Direction pour la Science Ouverte (DipSO) et constitué de scientifiques, d’édit.eur.rice.s de revues scientifiques et techniques portées par INRAE et de représentant.e.s de la Délégation ainsi que de membres de la Direction pour la Science Ouverte, de la Direction de l’Évaluation et de la Direction des Affaires Juridiques.Ce document traite spécifiquement des pratiques intègres de publication en lien direct avec la science ouverte et ne prétend pas couvrir l’intégralité des questions générales de science ouverte, ni de publication ou d’intégrité scientifique.