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Response of bacterial communities to Pb smelter pollution in contrasting soils

hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorSCHNEIDER, Arnaud R.
hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorGOMMEAUX, Maxime
hal.structure.identifierEcologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés - UMR CNRS 7058 UPJV [EDYSAN]
dc.contributor.authorDUCLERCQ, Jérôme
hal.structure.identifierInteractions Sol Plante Atmosphère [UMR ISPA]
dc.contributor.authorFANIN, Nicolas
hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorCONREUX, Alexandra
hal.structure.identifierEcologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés - UMR CNRS 7058 UPJV [EDYSAN]
dc.contributor.authorALAHMAD, Abdelrahman
hal.structure.identifierEcologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés - UMR CNRS 7058 UPJV [EDYSAN]
dc.contributor.authorLACOUX, Jérôme
hal.structure.identifierEcologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés - UMR CNRS 7058 UPJV [EDYSAN]
dc.contributor.authorROGER, David
hal.structure.identifierEcologie et Dynamique des Systèmes Anthropisés - UMR CNRS 7058 UPJV [EDYSAN]
dc.contributor.authorSPICHER, Fabien
hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorPONTHIEU, Marie
hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorCANCÈS, Benjamin
hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorMORVAN, Xavier
hal.structure.identifierGroupe d'Étude sur les Géomatériaux et Environnements Naturels, Anthropiques et Archéologiques - EA 3795 [GEGENAA]
hal.structure.identifierCentre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
dc.contributor.authorMARIN, Béatrice
dc.date.accessioned2024-04-08T12:09:52Z
dc.date.available2024-04-08T12:09:52Z
dc.date.issued2017
dc.identifier.issn0048-9697
dc.identifier.urihttps://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/196595
dc.description.abstractEnAnthropogenic inputs of trace elements (TE) into soils constitute a major public and environmental health problem. Bioavailability of TE is strongly related to the soil physicochemical parameters and thus to the ecosystem type. In order to test whether soil parameters influence the response of the bacterial community to TE pollution, we collected soil samples across contrasting ecosystems (hardwood, coniferous and hydromorphic soils), which have been contaminated in TE and especially lead (Pb) over several decades due to nearby industrial smelting activities. Bacterial community composition was analysed using high throughput amplicon sequencing and compared to the soil physicochemical parameters. Multivariate analyses of the pedological and biological data revealed that the bacterial community composition was affected by ecosystem type in the first place. An influence of the contamination level was also evidenced within each ecosystem. Despite the important variability in bacterial community structure, we found that specific bacterial groups such as γ-Proteobacteria, Verrucomicrobia and Chlamydiae showed a consistent response to Pb content across contrasting ecosystems. Verrucomicrobia were less abundant at high contamination level whereas Chlamydiae and γ-Proteobacteria were more abundant. We conclude that such groups and ratio's thereof can be considered as relevant bioindicators of Pb contamination.
dc.language.isoen
dc.publisherElsevier
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/
dc.subjectanthropique
dc.subjectbiodisponibilité
dc.subjectteneur en oligo element
dc.subjectanalyse de sol
dc.subject.enPb contamination
dc.subject.enPb bioavailability
dc.subject.enbacterial diversity
dc.subject.enbioindicator
dc.subject.enchlamydiae
dc.subject.enverrucomicrobia
dc.subject.enanthropic
dc.subject.enbioavailability
dc.subject.ensoil analysis
dc.title.enResponse of bacterial communities to Pb smelter pollution in contrasting soils
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.1016/j.scitotenv.2017.06.159
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]
bordeaux.journalScience of the Total Environment
bordeaux.page436-444
bordeaux.volume605-606
bordeaux.hal.laboratoriesInteractions Soil Plant Atmosphere (ISPA) - UMR 1391*
bordeaux.institutionBordeaux Sciences Agro
bordeaux.institutionINRAE
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-01604416
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceNon spécifiée
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-01604416v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.jtitle=Science%20of%20the%20Total%20Environment&rft.date=2017&rft.volume=605-606&rft.spage=436-444&rft.epage=436-444&rft.eissn=0048-9697&rft.issn=0048-9697&rft.au=SCHNEIDER,%20Arnaud%20R.&GOMMEAUX,%20Maxime&DUCLERCQ,%20J%C3%A9r%C3%B4me&FANIN,%20Nicolas&CONREUX,%20Alexandra&rft.genre=article


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