Mise en place de la RT-MLPA au laboratoire d'hématologie du CHU de Bordeaux. Intérêt dans l'identification des LAL B Phi-like

Abstract

La stratification pronostique des leucémies aigues lymphoblastiques B repose largement sur l’identification d’anomalies génétiques récurrentes. L’objectif principal de notre travail était d’évaluer les performances d’une technique de Reverse Transcription Multiplex Ligation Probe Assay (RT-MLPA) dans l’identification en routine des 4 principales anomalies génétiques récurrentes au diagnostic des LAL B (BCR::ABL1, ETV6::RUNX1, TCF3:BX1, KMT2A:AF4). Ces anomalies ont pu être mises en évidence avec une bonne sensibilité (95.6%) et une bonne spécificité (100%). D’autre part dans les LAL B, il existe une entité récemment mise en évidence: les « LAL B Phi-like ». Elles rassemblent plus de 60 anomalies génétiques ayant en commun une hyperactivation des voies de signalisations intracellulaires associées à des tyrosines kinases et sont associées à un mauvais pronostic. Afin d’évaluer l’apport de la RT-MLPA dans le diagnostic de ces LAL Phi-like, nous avons étudié de manière rétrospective une cohorte de 80 patients de plus de 25 ans, diagnostiqués au CHU de Bordeaux entre janvier 2008 à janvier 2018. Dans cette cohorte l’association de la RT-MLPA et d’une FISH ciblée sur IGH, EPOR et CRLF2 a permis d’identifier 8 patients (10% de la cohorte, et 22% des patients sans anomalie cytogénétique récurrente) avec une anomalie associée aux LAL B Phi-like, en majorité des réarrangements de CRLF2. Cette étude a permis d’adopter la RT-MLPA comme technique de routine au laboratoire d’hématologie du CHU de Bordeaux, pour tout diagnostic de LAL B, de l’enfant comme de l’adulte, au diagnostic et à la rechute, en association à la cytogénétique (caryotype, FISH KMT2A) et a permis de remplacer les 4 RT-PCR qualitatives.