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Identification of a novel vitivirus from pineapple in Reunion Island

hal.structure.identifierPeuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical [UMR PVBMT]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorLETT, Jean-Michel
hal.structure.identifierUnité Ravageurs et agents pathogènes tropicaux [RAPT]
hal.structure.identifierPeuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical [UMR PVBMT]
dc.contributor.authorMASSÉ, Delphine
hal.structure.identifierPlant Health Institute of Montpellier [UMR PHIM]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorFILLOUX, Denis
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorCANDRESSE, Thierry
hal.structure.identifierUnité de recherche TERRA [Gembloux]
dc.contributor.authorMASSART, Sébastien
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorMARAIS, Armelle
hal.structure.identifierUnité de Pathologie Végétale [PV]
dc.contributor.authorVERDIN, Eric
hal.structure.identifierUnité Ravageurs et agents pathogènes tropicaux [RAPT]
dc.contributor.authorCASSAM, Nathalie
hal.structure.identifierPlant Health Institute of Montpellier [UMR PHIM]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorFERNANDEZ, Emmanuel
hal.structure.identifierPlant Health Institute of Montpellier [UMR PHIM]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorROUMAGNAC, Philippe
hal.structure.identifierPeuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical [UMR PVBMT]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorTEYCHENEY, Pierre-Yves
hal.structure.identifierPeuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical [UMR PVBMT]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorLEFEUVRE, Pierre
dc.date.issued2022-02-18
dc.description.abstractEnWe report the complete genome sequencing of a novel member of the genus Vitivirus in the family Betaflexiviridae (subfamily Trivirinae) infecting pineapple. The full genome of this virus was obtained from total RNAs extracted from pineapple leaf samples collected in Reunion Island, using a combination of high-throughput sequencing technologies. It is 6,757 nt long, excluding the poly(A) tail, and shares all the hallmarks of vitiviruses. Phylogenetic analyses performed on the replication-associated protein and capsid protein gene sequences unambiguously place this new virus, for which we propose the name “pineapple vitivirus A”, in the Vitivirus genus.
dc.language.isoen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by/
dc.subject.enReunion Island
dc.subject.enphytopathogenic virus
dc.subject.enPineapple
dc.title.enIdentification of a novel vitivirus from pineapple in Reunion Island
dc.typeDocument de travail - Pré-publication
dc.typePrepublication/Preprint
dc.identifier.doi10.21203/rs.3.rs-1361865/v1
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale/Phytopathologie et phytopharmacie
dc.description.sponsorshipEuropeEuropean Union (ERDF, INTERREGV)
hal.identifierhal-03752377
hal.version1
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-03752377v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.date=2022-02-18&rft.au=LETT,%20Jean-Michel&MASS%C3%89,%20Delphine&FILLOUX,%20Denis&CANDRESSE,%20Thierry&MASSART,%20S%C3%A9bastien&rft.genre=preprint&unknown


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