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dc.contributor.advisorGrelet, Eric
dc.contributor.authorZAVALA MARTINEZ, Arantza
dc.contributor.otherGrelet, Eric
dc.contributor.otherZakri, Cécile
dc.contributor.otherLiz-Marzan, Luis M.
dc.contributor.otherFreyssingeas 19..-, Eric
dc.contributor.otherRamos, Laurence
dc.contributor.otherSandre, Olivier
dc.contributor.otherWürger, Alois
dc.date2022-05-23
dc.identifier.urihttp://www.theses.fr/2022BORD0177/abes
dc.identifier.uri
dc.identifier.nnt2022BORD0177
dc.description.abstractDans cette thèse, nous étudions la diffusion d'auto-assemblages hybrides à base des virus en forme de filament et des nanoparticules d'or. Dans ce but, nous utilisons des bactériophages qui ont été génétiquement modifiés afin de posséder des groupements cystéines exposés à leur extrémité proximale. La présence des ponts disulfure à l'une de leurs pointes leur permet ainsi de se lier aux nanoparticules métalliques par une liaison covalente de coordination. La morphologie des différents colloïdes hybrides formés dépend de l'excès molaire initial entre virus et nanoparticules. Lorsque les deux éléments sont placés dans la même proportion, leur interaction conduit à la formation de particules en forme d'allumettes (« matchstick-like ») qui consiste en un virus de 1 _m long attaché par sa pointe à une seule nanoparticule d'or. Cependant, si les virus sont en grand excès, cela se traduit par la formation de structures colloïdales en étoile (« colloidal stars ») formées par plusieurs virus attachés à une seule nanoparticule d'or. La dynamique brownienne de ces structures en régime dilué et dense a été étudiée pardiffusion dynamique de la lumière et par suivi temporel des particules individuelles enmicroscopie optique. L'un des avantages majeurs de l'utilisation combinée de ces deux techniques est la possibilité d'étudier séparément les différents éléments qui composent les colloïdes hybrides. Plus précisément, la forte diffusion de la lumière associée aux nanoparticules d'or permet la détermination des propriétés dynamiques de la structure en observant principalement la nanoparticule liée, alors que le marquage du virus avec des colorants fluorescents permet la mesure de leurs coefficients de diffusion par microscopie optique. Nos résultats sur la diffusion des particules « matchstick-like » en fonction de la taille des nanoparticules soulignent la flexibilité de la liaison virus-nanoparticule. Étant donné que ces structures sont intrinsèquement asymétriques, nous avons aussi évalué la possibilité d'induireune autopropulsion par effet thermophorétique afin d'obtenir des colloïdes hybrides actifs. Nous avons également étudié quantitativement l'auto-organisation et la diffusion des « colloidal stars » en fonction de leur fraction volumique. Lorsque la concentration augmente, on observe un arrêt progressif de leur dynamique liée à l'interdigitation des virus qui suggère un état vitreux en régime dense. Dans la dernière partie de cette thèse, nous formulons de nouveaux mutants de bactériophages qui ont la propriété de se lier à des nanoparticules métalliques aux deux extrémités. Ceci conduit au développement de nouvelles superstructures hybrides avec un design plus versatile.
dc.description.abstractEnIn this thesis, we report on the study of the self-diffusion of hybrid gold-virus self-assemblies formed by spherical gold nanoparticles and rod-like viruses. For this purpose, we use genetically modified mutants of filamentous bacteriophages which possess disulfide groups (Cys-Cys) exposed at their proximal end. The presence of a disulfide bridge allows them to bind to metal nanoparticles by one of their tips forming a weak covalent bond. The control of the resulting self-assembled structures is achieved by tuning the molar excess of viruses with respect to nanoparticles. When both components are set in similar proportion, their interaction leads to the formation of matchstick-like particles composed by a 1 µm long virus attached by its tip to a single gold nanobead. However, if the viruses are in high excess, the resulting structures are colloidal stars formed by multiple viruses attached to a single gold nanobead.The Brownian dynamics of these structures is characterized in dilute and dense regimes both by Dynamic Light Scattering (DLS) and single particle tracking through optical microscopy. An advantage of using both techniques resides in the possibility to study separately the different components forming the hybrid particles. Specifically, the high scattering signal coming from the gold nanoparticle facilitates the determination of the dynamic properties of the structure by observing mostly the bounded bead, whereas the labeling with fluorescent dyes allows the direct determination of the virus diffusion coefficient by microscopy.Our findings on the self-diffusion of the matchstick-like particles as a function of the nanoparticle size evidence the flexibility of the virus-bead link. Considering the intrinsic asymmetry of the matchstick-like structure, the possibility to induce self-propulsion has been investigated in order to get active hybrid particles by overcoming their Brownian motion thanks to light or chemical fuels.We quantitatively study the self-organization and diffusion of the colloidal stars as a function of the volume fraction. When the later increases, a progressive dynamical arrest related to the interdigitation of the star viral arms is observed suggesting a glassy state in the dense regime.In the last part of this thesis, we construct optimized new mutants of filamentous bacteriophages which are engineered to bind metal nanoparticles to both tips. This results in the development of novel hybrid superstructures with more versatile design.
dc.language.isoen
dc.subjectDiffusion dynamique de la lumière
dc.subjectBactériophage filamenteux
dc.subjectNanoparticule d'or
dc.subjectColloïdes hybrides
dc.subjectÉtat vitreux
dc.subjectAuto-assemblage
dc.subjectDiffusion
dc.subjectAuto-propulsion
dc.subject.enDynamic light scattering
dc.subject.enFilamentous bacteriophage
dc.subject.enSelf-assembly
dc.subject.enGold nanoparticles
dc.subject.enHybrid colloids
dc.subject.enGlassy state
dc.titleDynamique d'auto-assemblages de virus en bâtonnets et de nanoparticules d'or : des particules en forme de bâton aux étoiles colloïdales
dc.title.enDynamics of hybrid rod-like viruses and spherical gold nanoparticles self-assemblies : from matchstick-like particles to colloidal stars
dc.typeThèses de doctorat
dc.contributor.jurypresidentZakri, Cécile
bordeaux.hal.laboratoriesCentre de Recherche Paul Pascal (Pessac)
bordeaux.type.institutionBordeaux
bordeaux.thesis.disciplineLasers, Matière et Nanosciences
bordeaux.ecole.doctoraleÉcole doctorale des sciences physiques et de l’ingénieur (Talence, Gironde)
star.origin.linkhttps://www.theses.fr/2022BORD0177
dc.contributor.rapporteurLiz-Marzan, Luis M.
dc.contributor.rapporteurFreyssingeas 19..-, Eric
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=Dynamique%20d'auto-assemblages%20de%20virus%20en%20b%C3%A2tonnets%20et%20de%20nanoparticules%20d'or%20:%20des%20particules%20en%20forme%20de%20b%C3%A2ton%20aux%20%C3%A9to&rft.atitle=Dynamique%20d'auto-assemblages%20de%20virus%20en%20b%C3%A2tonnets%20et%20de%20nanoparticules%20d'or%20:%20des%20particules%20en%20forme%20de%20b%C3%A2ton%20aux%20%C3%A9t&rft.au=ZAVALA%20MARTINEZ,%20Arantza&rft.genre=unknown


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