Structures repliées et dynamique conformationnelle de peptidomimétiques à base d'oligoamides d'Aza-aromatiques
Thèses de doctorat
Date de soutenance
2004-10-08Résumé
Des oligoamides aromatiques de synthèse ont été conçus pour adopter des conformations hélicoïdales bien définies, stabilisées par la formation de liaisons hydrogène intramoléculaires. Ces architectures ont été caractérisées ...Lire la suite >
Des oligoamides aromatiques de synthèse ont été conçus pour adopter des conformations hélicoïdales bien définies, stabilisées par la formation de liaisons hydrogène intramoléculaires. Ces architectures ont été caractérisées dans le solide par diffraction des rayons X. Une analyse conformationnelle par RMN 2D, similaire à celle développée pour les peptides, a permis de confirmer la conformation hélicoïdale de ces brins moléculaires en solution. Ces structures repliées peuvent subir des modifications conformationnelles de large amplitude – dépliement, repliement- contrôlées par le pH et réversibles. Le sens d'hélicité de ces oligoamides peut être contrôlé par interaction intramoléculaire en introduisant un groupe chiral à l'extrémité du brin. Cette induction de chiralité semble dirigée principalement par des phénomènes stériques. La transmission du sens d'hélicité à travers des espaceurs placés entre deux segments hélicoïdaux d'oligoamide aromatique a permis de mettre en évidence la rétention ou l'inversion du sens d'hélicité, ou simplement l'absence de communication entre les deux segments, suivant la nature de l'espaceur. Une stratégie basée sur un encombrement stérique mutuel a conduit à la construction de la première hélice méso conçue de façon rationnelle.< Réduire
Résumé en anglais
Pyridine and quinoline-derived oligoamide foldamers have been designed to adopt welldefined helical conformations stabilized by intramolecular hydrogen bonds. These helical structures have been characterized in the solid ...Lire la suite >
Pyridine and quinoline-derived oligoamide foldamers have been designed to adopt welldefined helical conformations stabilized by intramolecular hydrogen bonds. These helical structures have been characterized in the solid state by single crystal X-ray diffraction. In solution, NMR experiments similar to those developed for solving the structures of pepdides have fully demonstrated that the solution conformations are identical to those observed in the solid state. Conformational transitions of large amplitude, such as unfolding and re-folding, can be triggered upon partial and selective protonation or full protonation of the oligoamides. Intramolecular chiral induction of the handedness has been observed in helical aromatic oligoamides bearing asymmetric centers at the end of the strand, and seems to be directed by steric phenomena. Transmission of the handedness across a spacer placed between two helical segments leads to retention or inversion of the handedness, or simply to the absence of communication between the two segments, depending on the topology of the spacer. A strategy based on mutual steric exclusion has allowed the construction of the first designed meso-helices.< Réduire
Mots clés
Chimie Organique
Chimie supramoléculaire
Foldamères d’oligoamides aromatiques
Auto-organisation
Liaisons hydrogène
Empilement aromatique
Structures hélicoïdales
Analyse conformationnelle
Mouvements contrôlés
Chiralité
Transmission du sens d’hélicité
Unités de recherche