Molecular diversity of yam virus Y and identification of banana mild mosaic virus isolates infecting yam (Dioscorea spp.)
DIOUF, Mame Boucar
Agrosystèmes tropicaux [ASTRO]
Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP]
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FILLOUX, Denis
Plant Health Institute of Montpellier [UMR PHIM]
Département Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
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TEYCHENEY, Pierre Yves
Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical [UMR PVBMT]
Département Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
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Langue
en
Article de revue
Ce document a été publié dans
Archives of Virology. 2023-06-13, vol. 168, n° 7, p. 180
Springer Verlag
Résumé en anglais
Two members of the family Betaflexiviridae associated with yam (Dioscorea spp.) have been described so far: yam latent virus (YLV) and yam virus Y (YVY). However, their geographical distribution and molecular diversity ...Lire la suite >
Two members of the family Betaflexiviridae associated with yam (Dioscorea spp.) have been described so far: yam latent virus (YLV) and yam virus Y (YVY). However, their geographical distribution and molecular diversity remain poorly documented. Using a nested RT-PCR assay, we detected YVY in D. alata, D. bulbifera, D. cayenensis, D. rotundata , and D. trifida in Guadeloupe, and in D. rotundata in Côte d'Ivoire, thus extending the known host range of this virus and geographical distribution. Using amplicon sequencing, we determined that the molecular diversity of YVY in the yam samples analyzed in this work ranged between 0.0 and 29.1% and that this diversity is partially geographically structured. We also identified three isolates of banana mild mosaic virus (BanMMV) infecting D. alata in Guadeloupe, providing the first evidence for BanMMV infection in yam.< Réduire
Projet Européen
Maladies infectieuses en milieu insulaire tropical
Project ANR
Amélioration du diagnostic viral pour sécuriser les ressources génétiques végétales - ANR-11-EBIM-0002
Origine
Importé de halUnités de recherche