Pineline : Une base de données couplée à une application web pour le suivi en continu de la dynamique temporelle de croissance radiale du Pin maritime en Aquitaine

Abstract

L’UMR BIOGECO (Campus forêt bois de Cestas Pierroton) étudie la dynamique temporelle de croissance et de statut hydrique des arbres grâce à des dispositifs instrumentés à l’aide de micro-dendromètres électroniques couplés à des capteurs de suivi environnementaux. L’ampleur de ce réseau rendait compliquée la gestion, à la fois, des dispositifs instrumentés et des données générées par l’ensemble des capteurs installés. L’ensemble des acteurs de ce réseau, chercheurs, ingénieurs et techniciens, a donc été impliqué dans l’élaboration du cahier des charges, à l’occasion de l’encadrement d’une étudiante, afin de développer une application web couplée à une base de données : PINELINE. Cet outil informatique permet de stocker et de mettre à disposition les données de phénotypage à haut débit des micro-variations radiales du tronc et les variables environnementales, pour des populations de pin maritime dans la forêt des Landes de Gascogne. Depuis 2011, au sein de l’UMR BIOGECO, plusieurs projets de recherche ont permis d’équiper un réseau de 5 dispositifs expérimentaux, pour étudier la réponse des arbres aux contraintes abiotiques, en fonction de leurs caractéristiques génétiques et des pratiques sylvicoles. Ces équipements permettent le suivi temporel automatisé des variations radiales des troncs des arbres, avec une précision au micromètre, et sont associés à des capteurs d’enregistrement de variables environnementales associées (humidité du sol, hauteur de la nappe, température, rayonnement incident), avec une fréquence de mesures horaire ou sub-horaire sur plusieurs années. Le soutien du LabEx COTE a permis de lever les freins à la gestion technique de tels dispositifs instrumentés et le développement d’une application web associée à une base de données spécifiquement dédiée à l’enregistrement des mesures phénotypiques et environnementales à haut-débit et leur mise à disposition de la communauté scientifique.