Afficher la notice abrégée

Yam asymptomatic virus 1, a novel virus infecting yams (Dioscorea spp.) with significant prevalence in a germplasm collection

hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorMARAIS, Armelle
hal.structure.identifierAgrosystèmes tropicaux [ASTRO]
dc.contributor.authorUMBER, Marie
hal.structure.identifierBiologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite [UMR BGPI]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorFILLOUX, Denis
hal.structure.identifierAgrosystèmes tropicaux [ASTRO]
dc.contributor.authorGOMEZ, Rose-Marie
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorFAURE, Chantal
hal.structure.identifierAgrosystèmes tropicaux [ASTRO]
dc.contributor.authorPAVIS, Claudie
hal.structure.identifierBiologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite [UMR BGPI]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorJULIAN, Charlotte
hal.structure.identifierBiologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite [UMR BGPI]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorROUMAGNAC, Philippe
hal.structure.identifierAmélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP]
dc.contributor.authorACINA-MAMBOLE, Isabelle
hal.structure.identifierAgrosystèmes tropicaux [ASTRO]
dc.contributor.authorBONHEUR, Lydiane
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
hal.structure.identifierUnité Mixte de Recherche sur le Fromage [UMRF]
dc.contributor.authorTHEIL, Sébastien
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorCONTRERAS, Sandy
hal.structure.identifierBiologie du fruit et pathologie [BFP]
dc.contributor.authorCANDRESSE, Thierry
hal.structure.identifierAmélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales [UMR AGAP]
hal.structure.identifierDépartement Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
dc.contributor.authorTEYCHENEY, Pierre-Yves
dc.date.issued2020
dc.identifier.issn0304-8608
dc.description.abstractEnA novel virus infecting yams (Dioscoreaspp.), tentatively named "yam asymptomatic virus 1" (YaV1), was characterized and sequenced from an asymptomaticD. alataplant from Vanuatu. Sequence comparisons and phylogenetic analysis showed that YaV1 is a novel ampelovirus and has the smallest genome among "subgroup 1" members. RT-PCR-based screening of a yam germplasm collection conserved in Guadeloupe showed that YaV1 is prevalent inD. alata,D. bulbifera,D. cayennensissubsp. rotundata,D. esculentaandD. trifidaaccessions but causes no apparent symptoms. Additional phylogenetic analysis revealed a low variability of YaV1 in Guadeloupe in a limited part of the genome, and suggested the occurrence of plant-to-plant transmission.
dc.description.sponsorshipAmélioration du diagnostic viral pour sécuriser les ressources génétiques végétales - ANR-11-EBIM-0002
dc.language.isoen
dc.publisherSpringer Verlag
dc.subjectcaracterisation
dc.subjectIgname
dc.subjectDioscorea spp.
dc.subjectVirologie végétale
dc.subjectVirus phytopathogène
dc.subjectPlante tropicale
dc.subject.enhigh-throughput sequencing
dc.subject.enampelovirus
dc.subject.enphylogenetic analysis
dc.subject.enSequence
dc.subject.enYaV1
dc.subject.enyam asymptomatic virus 1
dc.title.enYam asymptomatic virus 1, a novel virus infecting yams (Dioscorea spp.) with significant prevalence in a germplasm collection
dc.typeArticle de revue
dc.identifier.doi10.1007/s00705-020-04787-0
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale/Phytopathologie et phytopharmacie
bordeaux.journalArchives of Virology
bordeaux.page2653-2657
bordeaux.volume165
bordeaux.issue11
bordeaux.peerReviewedoui
hal.identifierhal-02926860
hal.version1
hal.popularnon
hal.audienceInternationale
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-02926860v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.jtitle=Archives%20of%20Virology&rft.date=2020&rft.volume=165&rft.issue=11&rft.spage=2653-2657&rft.epage=2653-2657&rft.eissn=0304-8608&rft.issn=0304-8608&rft.au=MARAIS,%20Armelle&UMBER,%20Marie&FILLOUX,%20Denis&GOMEZ,%20Rose-Marie&FAURE,%20Chantal&rft.genre=article


Fichier(s) constituant ce document

FichiersTailleFormatVue

Il n'y a pas de fichiers associés à ce document.

Ce document figure dans la(les) collection(s) suivante(s)

Afficher la notice abrégée