Yam asymptomatic virus 1, a novel virus infecting yams (Dioscorea spp.) with significant prevalence in a germplasm collection
FILLOUX, Denis
Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite [UMR BGPI]
Département Systèmes Biologiques [Cirad-BIOS]
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Langue
en
Article de revue
Ce document a été publié dans
Archives of Virology. 2020, vol. 165, n° 11, p. 2653-2657
Springer Verlag
Résumé en anglais
A novel virus infecting yams (Dioscoreaspp.), tentatively named "yam asymptomatic virus 1" (YaV1), was characterized and sequenced from an asymptomaticD. alataplant from Vanuatu. Sequence comparisons and phylogenetic ...Lire la suite >
A novel virus infecting yams (Dioscoreaspp.), tentatively named "yam asymptomatic virus 1" (YaV1), was characterized and sequenced from an asymptomaticD. alataplant from Vanuatu. Sequence comparisons and phylogenetic analysis showed that YaV1 is a novel ampelovirus and has the smallest genome among "subgroup 1" members. RT-PCR-based screening of a yam germplasm collection conserved in Guadeloupe showed that YaV1 is prevalent inD. alata,D. bulbifera,D. cayennensissubsp. rotundata,D. esculentaandD. trifidaaccessions but causes no apparent symptoms. Additional phylogenetic analysis revealed a low variability of YaV1 in Guadeloupe in a limited part of the genome, and suggested the occurrence of plant-to-plant transmission.< Réduire
Mots clés
caracterisation
Igname
Dioscorea spp.
Virologie végétale
Virus phytopathogène
Plante tropicale
Mots clés en anglais
high-throughput sequencing
ampelovirus
phylogenetic analysis
Sequence
YaV1
yam asymptomatic virus 1
Project ANR
Amélioration du diagnostic viral pour sécuriser les ressources génétiques végétales - ANR-11-EBIM-0002
Origine
Importé de halUnités de recherche