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hal.structure.identifierLaboratoire Bordelais de Recherche en Informatique [LaBRI]
hal.structure.identifierfrom patterns to models in computational biodiversity and biotechnology [PLEIADE]
dc.contributor.authorISSA, Razanne
hal.structure.identifierfrom patterns to models in computational biodiversity and biotechnology [PLEIADE]
hal.structure.identifierLaboratoire Bordelais de Recherche en Informatique [LaBRI]
dc.contributor.authorSHERMAN, David James
dc.date.created2016-02
dc.date.issued2018-12
dc.description.abstractNous définissons une procédure formelle pour l’inférence de relations gène-protéine- réaction (GPR) à partir de modèles métaboliques complets, par moyen d’une représentation logique des connaissances et un petit ensemble de règles d’inférence. Nous montrons que les différents cas d’utilisation requièrent des différentes relations GPR. Trois exemples tirés de la levure Saccharomyces cerevisae illustrent la procédure et démontrent son utilité.
dc.description.abstractEnWe define a formal procedure for inferring gene-protein-reaction (GPR) relations from complete metabolic models, using a logical representation of knowledge and a small set of inference rules. We show that different use cases of metabolic models requires difference GPR relations. Three examples from the yeast Saccharomyces cerevisae illustrate the procedure and demonstrate its usefulness.
dc.language.isoen
dc.subjectRéseaux métaboliques
dc.subjectGénomique comparée
dc.subjectInférence
dc.subject.enComparative genomics
dc.subject.enMetabolic networks
dc.titleDériver des associations de gène pour des modèles métaboliques
dc.title.enDeriving Gene Associations for Metabolic Models
dc.typeRapport
dc.subject.halInformatique [cs]/Bio-informatique [q-bio.QM]
bordeaux.type.institutionInria Bordeaux Sud-Ouest
bordeaux.type.reportrr
hal.identifierhal-01976744
hal.version1
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//hal-01976744v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=D%C3%A9river%20des%20associations%20de%20g%C3%A8ne%20pour%20des%20mod%C3%A8les%20m%C3%A9taboliques&rft.atitle=D%C3%A9river%20des%20associations%20de%20g%C3%A8ne%20pour%20des%20mod%C3%A8les%20m%C3%A9taboliques&rft.date=2018-12&rft.au=ISSA,%20Razanne&SHERMAN,%20David%20James&rft.genre=unknown


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