Multiplex real‐time PCR assays for the detection and identification of Heterobasidion species attacking conifers in Europe
IOOS, R.
Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail [ANSES]
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CHRETIEN, P.
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PERRAULT, J.
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IOOS, R.
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CHRETIEN, P.
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PERRAULT, J.
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JEANDEL, C.
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Idioma
en
Article de revue
Este ítem está publicado en
Plant Pathology. 2019, vol. online first
Wiley
Resumen en inglés
Four species of the destructive forest pathogen Heterobasidion annosum sensu lato (s.l.) are present in Europe: H. annosum sensu stricto (s.s.), H. abietinum and H. parviporum are native species, while H. irregulare is a ...Leer más >
Four species of the destructive forest pathogen Heterobasidion annosum sensu lato (s.l.) are present in Europe: H. annosum sensu stricto (s.s.), H. abietinum and H. parviporum are native species, while H. irregulare is a non-native invasive species currently reported only in Italy, yet recommended for regulation throughout Europe. In this study, real-time PCR detection tests were developed for each of the four species, which can be used simultaneously or individually thanks to probes labelled with species-specific fluorescent dyes. The different performance criteria of each assay were evaluated, and it was determined that they were theoretically capable of detecting amounts of DNA corresponding to 311, 29 and 29 cell nuclei in H. annosum s.s., H. irregulare and H. parviporum, respectively. The specificity of each assay was assessed with a wide set of strains. Real-time PCR tests successfully detected Heterobasidion species from 36 fruiting bodies taken from the forest, as well as from artificially inoculated or naturally infected wood samples. The multiplex real-time PCR assays developed in this study could have practical applications both in forest management and in phytosanitary monitoring.< Leer menos
Palabras clave en inglés
conifer root rot
molecular assay
monitoring
Proyecto ANR
Recherches Avancées sur l'Arbre et les Ecosytèmes Forestiers - ANR-11-LABX-0002
Orígen
Importado de HalCentros de investigación