FaMoz un logiciel pour faire des études de parenté à partir de marqueurs codominants et dominants
| hal.structure.identifier | Biodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo] | |
| dc.contributor.author | GERBER, Sophie | |
| hal.structure.identifier | Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse [MIAT INRA] | |
| dc.contributor.author | CHABRIER, Patrick | |
| hal.structure.identifier | Biodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo] | |
| dc.contributor.author | KREMER, Antoine | |
| hal.structure.identifier | Unité de recherches forestières [BORDX PIERR UR ] | |
| dc.contributor.author | LABBÉ, Thierry | |
| dc.date.issued | 2013 | |
| dc.description.abstract | FaMoz (un acronyme pour père/mère -father/mother- en anglais) est un logiciel utile pour reconstruire des parentés à partir de marqueurs dominants et codominants. Il est écrit dans les langages C et TclTk et est téléchargeable et utilisable sur des systèmes Unix, Linux et Windows. Les paramètres et les hypothèses utilisées dans les calculs sont peu nombreux et simples. Les probabilités d'identité et d'exclusion, les log-vraisemblances des pères, parents et paires de parents potentiels sont calculées à partir de données réelles ou simulées. Des taux d'erreur, liés à de mauvais génotypages, peuvent être introduits. Des simulations peuvent être faites pour construire des tests statistiques afin d'affecter les parentés. | |
| dc.description.abstractEn | FAMOZ (an acronym for father/mother) is a software useful in reconstructing parentage for dominant, codominant markers. It is written in C and TclTk languages and is available to be downloaded for Unix, Linux and Windows systems. Parameters and assumptions used in the calculations are few and simple. Exclusion and identity probabilities, log-likelihoods of potential father and parent or parent pair are calculated based on real or simulated data. Error rates for genotypic mistyping can be introduced. Simulations can be done to build statistical tests for parentage assignment. | |
| dc.language.iso | en | |
| dc.subject.en | Parentage analysis | |
| dc.subject.en | likelihood | |
| dc.title | FaMoz un logiciel pour faire des études de parenté à partir de marqueurs codominants et dominants | |
| dc.title.en | FaMoz a software for parentage studies for codominant and dominant markers | |
| dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio]/Sciences agricoles/Sylviculture, foresterie | |
| dc.subject.hal | Statistiques [stat] | |
| dc.subject.hal | Sciences du Vivant [q-bio] | |
| dc.description.sponsorshipEurope | European projects BIO4 CT96 0706 | |
| dc.description.sponsorshipEurope | OAKFLOW | |
| hal.identifier | hal-02806496 | |
| hal.version | 1 | |
| hal.popular | non | |
| hal.origin.link | https://hal.archives-ouvertes.fr//hal-02806496v1 | |
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