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dc.contributor.advisorSophie Gerber
hal.structure.identifierBiodiversité, Gènes & Communautés [BioGeCo]
dc.contributor.authorLEPAIS, Olivier
dc.date.accessioned2022-10-12T12:25:31Z
dc.date.available2022-10-12T12:25:31Z
dc.identifier.urihttps://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/156171
dc.description.abstractL’hybridation est un processus aux conséquences diverses sur l’évolution des espèces qui est difficile à étudier lorsque les espèces se distinguent mal au niveau morphologique. Afin de comprendre le rôle de l'hybridation dans l’évolution du complexe d’espèces des chênes blancs européens, nous avons utilisé des outils de la génétique des populations pour quantifier les flux de gènes interspécifiques contemporains et étudier le système de reproduction de quatre espèces. Un protocole d'analyse génétique rapide a été développé et des méthodes d’assignations génétiques, permettant de déterminer l’espèce de chaque arbre et d’identifier les hybrides, ont été testées par simulations. Cette méthode a été appliquée en populations naturelles révélant un pourcentage d'hybrides variant de 10 à 30% en fonction des populations et impliquant tous les couples d'espèces. Nous avons montré que les effectifs des espèces dans les parcelles influencent la dynamique d'hybridation et la directionalité de l'introgression. Nous avons étudié le système de reproduction de ces espèces en croisements contrôlés et en forêt pour expliquer le maintien des espèces malgré la présence de flux de gènes interspécifiques. L'existence de plusieurs barrières reproductives contribue à un isolement partiel des espèces qui dépend principalement de barrières préreproductives et prézygotiques. Une analyse de paternité pratiquée sur des descendances récoltées en forêt montre que l'hybridation de première génération est rare mais que ces hybrides F1 sont fertiles et se reproduisent principalement avec l'une des espèces parentales, produisant de nombreux rétrocroisements qui expliquent le fort pourcentage d'hybrides observé dans les populations naturelles étudiées. L'hybridation et l'introgression sont donc des processus à l'oeuvre chez les chênes qui contribuent à l'évolution du complexe d'espèces.
dc.description.abstractEnHybridisation is a complex process with diverse consequences on species evolution. Hybridisation is difficult to study when species are not clearly morphologically distinguished. Our aim was to study the role of hybridisation in the evolution of the European white oak species complex. We used population genetic tools to quantify contemporary interspecific gene flow and to study the mating system of four oak species. A fast genetic analysis protocol was developed and genetic assignment methods were first tested by simulation and then used to determine the species of each tree and to identify hybrids. These methods revealed that hybrid percentages were between 10 to 30% depending on the natural population studied and that all species pairs were involved. We showed that the census number of species in the stands had an influence on hybridisation dynamics and on introgression direction. We studied the mating system of these species in controlled crosses and in the forest to understand the maintenance of species despite interspecific gene flow. Several reproductive barriers contribute to a partial isolation of species, mostly pre-reproductive and prezygotic. A paternity analysis of maternal progenies sampled in the forest showed that first generation hybridisation was rare but that F1 hybrids were fertile and were mating mostly with one of the two parental species, creating numerous backcrosses that explain the high percentages of hybrids observed in the natural populations studied. Hybridisation and introgression are active processes in oaks and contribute to the evolution of the species complex.
dc.language.isofr
dc.subjectASSIGNATION GENETIQUE
dc.subjectMICROSATELLITES
dc.subjectQUERCUS
dc.subjectHYBRIDISATION
dc.subjectQUERCUS PETRAEA
dc.subjectQUERCUS PYRENAICA
dc.subjectCHENE PUBESCENT
dc.subjectGENETIQUE DES POPULATIONS
dc.subjectCHENE SESSILE
dc.subject.enHYBRIDATION
dc.subject.enINTROGRESSION
dc.subject.enDELIMITATION D'ESPECES
dc.subject.enANALYSE DE PATERNITE
dc.subject.enCHENES
dc.subject.enSPECIES DELINEATION
dc.subject.enGENETIC ASSIGNMENT
dc.subject.enPATERNITY ANALYSES
dc.subject.enOAKS
dc.subject.enCHENE PEDONCULE
dc.subject.enCHENE BLANC EUROPEEN
dc.titleDynamique d'hybridation dans le complexe d'espèces des chênes blancs européens (Chênes pédonculés - Quercus robur L., sessiles - Q. petraea (Matt.) Liebl., pubescents -Q. pubescens Willd. et tauzins - Q. pyrenaica Willd.)
dc.title.enHybridisation dynamics in the European white oak species complex (pedunculate oak - Quercus robur L., sessile - Q. petraea (Matt.) Liebl., pubescent - Q. pubescens Willd. and pyrenean - Q. pyrenaica Willd.)
dc.typeThèses de doctorat
dc.subject.halSciences du Vivant [q-bio]
bordeaux.page278 p.
bordeaux.hal.laboratoriesBioGeCo (Biodiversité Gènes & Communautés) - UMR 1202*
bordeaux.institutionUniversité de Bordeaux
bordeaux.institutionINRAE
bordeaux.type.institutionUniversité des Sciences et Technologies (Bordeaux 1)
hal.identifiertel-02821939
hal.version1
hal.origin.linkhttps://hal.archives-ouvertes.fr//tel-02821939v1
bordeaux.COinSctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:journal&rft.title=Dynamique%20d'hybridation%20dans%20le%20complexe%20d'esp%C3%A8ces%20des%20ch%C3%AAnes%20blancs%20europ%C3%A9ens%20(Ch%C3%AAnes%20p%C3%A9doncul%C3%A9s%20-%20Quercus%20robu&rft.atitle=Dynamique%20d'hybridation%20dans%20le%20complexe%20d'esp%C3%A8ces%20des%20ch%C3%AAnes%20blancs%20europ%C3%A9ens%20(Ch%C3%AAnes%20p%C3%A9doncul%C3%A9s%20-%20Quercus%20rob&rft.spage=278%20p.&rft.epage=278%20p.&rft.au=LEPAIS,%20Olivier&rft.genre=unknown


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