Mise en place et vérification de méthode de la PCR HPV sur cobas® 6800 pour le dépistage du cancer du col de l’utérus au CHU de Bordeaux

Abstract

Depuis 2019, pour les femmes de plus de 30 ans, le dépistage du cancer du col de l’utérus (CCU) en France repose en première intention sur le test HPV, qui correspond à la détection des acides nucléiques des HPV à haut-risque (HPV-HR) par biologie moléculaire sur frottis cervico-utérin (FCU). Ce travail décrit la mise en place et la vérification de méthode en portée A de la PCR multiplex en temps réel cobas® HPV, marquée CE-IVD (Conformité Européenne In Vitro Diagnostic), pour la détection des HPV-HR dans le cadre du dépistage du CCU sur l’automate cobas® 6800 system (Roche Diagnostics, Meylan, France) au laboratoire de Virologie du CHU de Bordeaux. Une évaluation des performances analytiques a été réalisée afin de répondre aux exigences de la norme ISO 15189, ainsi qu’une comparaison avec la méthode précédemment en place, Xpert® HPV sur l’automate Cepheid GeneXpert® (Cepheid Europe SAS, Maurens-Scopont, France). Pour les résultats discordants, une troisième technique, le génotypage Anyplex II HPV28 Detection (Seegene, Eschborn, Germany), a été utilisée. La répétabilité a été évaluée sur des milieux de transport vierges, sur des échantillons négatifs et positifs et a présenté des résultats satisfaisants. Les résultats de la fidélité intermédiaire, appréciés sur un pool d’échantillons positifs servant de contrôle de qualité interne, sont conformes. Le laboratoire a obtenu la note maximale sur le programme d’évaluation externe de la qualité et aucune contamination n’a été mise en évidence dans l’essai effectué. Les résultats des deux méthodes pour 45 FCU de patientes ont été confrontés : 38 prélèvements présentaient des résultats concordants, 4 HPV-HR n’ont pas été détectés par cobas® HPV alors qu’ils étaient détectés avec Xpert® HPV (dont 2 prélèvements positifs faibles), 3 échantillons ont été rendus positifs sur cobas® 6800 alors qu’interprétés non détectables par le Cepheid GenXpert® (cycle d’amplification trop tardif). Les aspects pratiques de la mise en place de la méthode, la réorganisation du laboratoire et du circuit des prélèvements ont également été discutés. La technique cobas® HPV est mise en production depuis janvier 2021 au CHU de Bordeaux.