https://oskar-bordeaux.fr:443 Le site collecte, stocke, indexe, archive, et diffuse des documents de recherche en format numérique. 2026-04-22T11:34:09Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/188901 BERNASQUE, Antoine; CARIO, Muriel; KRISA, Stéphanie; LECOMTE, Sophie; FAURE, Chrystel 2023-02-13T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/171788 Silencing of RND3/RHOE inhibits the growth of human hepatocellular carcinoma and is associated with reversible senescence BASBOUS, Sara; PAYSAN, Lisa; SENA, Sandra; ALLAIN, Nathalie; HIRIART, Jean-Baptiste; DUGOT-SENANT, Nathalie; ROUSSEAU, Benoît; CHEVRET, Edith; LAGREE, Valerie; MOREAU, Violaine 2022-05-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/182512 Marqueurs biologiques du diabète : apports et discordances des nouvelles technologies. À propos d’un cas clinique MIALON, Florian; CATARGI, Bogdan; RAMI, Lila; BARAT, Pascal; BEDEL, Aurelie; LACAPE, Genevieve; BERARD, Annie M.; BEAUVIEUX, Marie Christine Des discordances potentielles sont observées par les praticiens de diabétologie chez certains patients entre les marqueurs « classiques » du diabète (hémoglobine A1c, HbA1c) et les « nouveaux » marqueurs issus du monitorage continu du glucose (CGM, Continuous Glucose Monitoring). Les dispositifs de CGM donnent une HbA1c estimée ou eA1c, calculée selon la glycémie interstitielle moyenne et corrélée au temps relatif passé dans la cible glycémique ou Time-in-Range (TIR, %). Nous rapportons, à travers un cas clinique, l’existence de discordances et explorons leurs causes potentielles. L’eA1c est rendue sur la base des données recueillies par un capteur dont la durée de vie est de 14 jours, et l’HbA1c est un reflet rétrospectif sur 8 à 12 semaines de l’exposition à l’hyperglycémie. La patiente présentait un mauvais contrôle glycémique, se traduisant par une eA1c à 9 % contre une HbA1c dosée à 7,4 % et 7,7 % respectivement en immuno-dosage délocalisé (Siemens DCA- Vantage®) et en HPLC (Variant II Turbo). En plus des données du CGM, le déséquilibre glycémique et son caractère récent ont pu être objectivés par une fraction labile de l’HbA1c (LA1c) augmentée en HPLC. Ainsi, des variations récentes et/ou importantes du contrôle glycémique vont creuser un écart entre l’HbA1c et l’eA1c, pouvant induire des décisions thérapeutiques erronées. La nature différente des marqueurs les rend difficilement comparables en particulier en termes de durée de mesure. Ces dispositifs de lecture du glucose interstitiel en continu sont largement utilisés, il est important de comprendre et maîtriser les données qu’ils fournissent. 2021-09-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/171743 HERAUD, Capucine; PINAULT, Mathilde; NEAUD, Veronique; SALTEL, Frédéric; LAGREE, Valerie; MOREAU, Violaine 2022-12-11T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/142310 Génomique appliquée à l'étude des infections par les bactéries des genres Campylobacter et Helicobacter. JEHANNE, Quentin Les infections bactériennes intestinales et gastriques par les bactéries du genre Campylobacter et Helicobacter sont très fréquentes: l’une pouvant provoquer des gastro-entérites sévères des suites d’une contamination alimentaire (principalement la viande) et l’autre étant liée au développement d’ulcères ou bien de cancers gastriques. Plus de 200 000 cas de campylobacterioses sont recensés dans l’Union Européenne chaque année, avec comme principale espèce Campylobacter jejuni. De plus, environ 50% de la population mondiale est infectée par Helicobacter pylori. De très nombreuses souches de Campylobacter et de biopsies gastriques sont reçues quotidiennement au CNR des Campylobacters et des Hélicobacters (CNRCH) où y sont menées des analyses telles l’identification de l’espèce et de la résistance aux antibiotiques. Plusieurs méthodes sont mises en place pour étudier ces pathogènes : cultures bactériennes, antibiogrammes, spectromètre de masse MALDI-TOF et extraction d’ADN pour des PCR en temps réel. Malgré la rapidité et le moindre coût de ces méthodes, les utiliser en routine présente des désavantages notamment des identifications d’espèces parfois non concluantes avec le MALDI-TOF ou la difficulté de déterminer les mécanismes moléculaires de résistance. Aujourd’hui, le séquençage haut débit couplé à la bio-informatique permet de générer des données cruciales pour résoudre ces nombreuses problématiques rencontrées en laboratoire. C’est en vue de moderniser les analyses de cas cliniques français effectuées au CNRCH que différents outils et scripts bio-informatiques ont été mis en place mais aussi développés durant ce doctorat. Le principal objectif étant d’enrichir nos connaissances sur ces infections bactériennes : de mettre en évidence des variations dans les séquences d’ADN (gène et mutations) mais aussi protéiques impliquées dans diverses problématiques. Ainsi, il a pu être identifié durant ces trois années : des SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) dans le génome de Campylobacter coli spécifiques à trois différentes sources de contamination (la volaille, les bovins et les porcs), des nouveaux gènes de résistance aux antibiotiques qui émergent sur le territoire métropolitain mais aussi des nouvelles espèces du genre Helicobacter ou Campylobacter. Ces outils et données sont d’ores et déjà utilisés en routine au sein du CNRCH. Toutes ces analyses ont pu être possibles via l’utilisation de l’environnement Linux (progammation Bash et Python) permettant d’étudier des milliers de séquences d’ADN provenant d’une variété de souches séquencées au cours des différents projets. Cette «exploration génomique» fût ici la clé pour répondre aux différentes problématiques cliniques. https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/202534 RAMEL, Eloise; PREY, Sorilla; DUTRIAUX, Caroline; GERARD, Emilie; PHAM-LEDARD, Anne; BEYLOT-BARRY, Marie; KOSTINE, Marie 2024-01-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/205564 SEENEEVASSEN, Lornella; ZAAFOUR, Anissa; SIFRE, Elodie; GENEVOIS, Coralie; NGUYEN, Tra Ly; POBIEDONOSCEW, Yasmine; GIESE, Alban; GUIGNARD, Jérôme; TIFFON, Camille; ROUSSEAU, Benoit; RAYMOND, Anne-Aurélie; BELLEANNÉE, Geneviève; BOEUF, Hélène; GRONNIER, Caroline; MARTIN, Oceane; GIRAUD, Julie; LEHOURS, Philippe; DUBUS, Pierre; VARON, Christine 2024-01-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/205893 BEAUMONT, Pauline; AMINTAS, Samuel; KRISA, Stéphanie; COURTOIS, Arnaud; RICHARD, Tristan; ESEBERRI, Itziar; PORTILLO, Maria P 2024-07-31T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/202411 EL MESSAOUDI, Selma; BRICHLER, Segolene; FOUGEROU-LEURENT, Claire; GORDIEN, Emmanuel; GERBER, Athenaïs; KORTEBI, Amal; LAGADIC, Garance; SUBIC-LEVRERO, Miroslava; MÉTIVIER, Sophie; POL, Stanislas; MINELLO, Anne; RATZIU, Vlad; LEROY, Vincent; MATHURIN, Philippe; ALRIC, Laurent; COULIBALY, Fatoumata; PAWLOTSKY, Jean-Michel; ZOULIM, Fabien; DE LEDINGHEN, Victor; GUEDJ, Jérémie; GROUP, Anrs Hd Ep Buledelta Study 2024-08-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/202709 CHAILLOT, Laura; BLONDOT, Marie-Lise; RECORDON-PINSON, Patricia; PELLEGRIN, Isabelle; BOIZARD-MORACCHINI, Andrea; SLIUSAR, Myroslava; PUJOL, Nadège; ANDREOLA, Marie-Line; BONNET, Fabrice; RECHER, Gaelle; ANDRIQUE, Leatitia; NASSOY, Pierre; MATHIVET, Thomas; BIKFALVI, Andreas https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/183419 ABEL, Aurore; LAZARO, Estibaliz; RALAZAMAHALEO, Mamy; PIERRISNARD, Emma; SUZON, Benoit; BONNET, Fabrice; MERCIÉ, Patrick; MACEY, Julie; AGOSSOU, Moustapha; VIALLARD, Jean-Francois; DELIGNY, Christophe; RIVIÈRE, Etienne 2023-06-15T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/182140 SOUBEYRAN, Pierre; BELLERA, Carine; PAILLAUD, Elena 2023-04-04T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/172053 GUILLARD, Isabelle; SAILLOUR-GLENISSON, Florence; LAFARGUE, Aurelie; SALESSES, Fabien; ROUBAUD BAUDRON, Claire; BERGER, Valerie; BOURDEL-MARCHASSON, Isabelle 2022-09-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/184671 HÉMAR, Victor; CAMOU, Fabrice; ROUBAUD, Claire; TERNACLE, Julien; PERNOT, Mathieu; GREIB, Carine; DIJOS, Marina; WIRTH, Gaetane; CHAUSSADE, Hélène; PEUCHANT, Olivia; BONNET, Fabrice; ISSA, N 2023-06-27T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/184665 FOUCHE, Donatien; CHENAIS, Gabrielle; HAISSAGUERRE, Magalie; BOURIEZ, Damien; GRONNIER, Caroline; COLLET, Denis; TABARIN, Antoine; NAJAH, Haythem 2023-10-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/170119 DUPIN, Charles; SUTTER, Jade; AMINTAS, Samuel; DERIEPPE, Marie-Alix; LALANNE, Magalie; COULIBALY, Soule; GUYON, Joris; DAUBON, Thomas; BOUTIN, Julian; BLOUIN, Jean Marc; RICHARD, Emmanuel; MOREAU-GAUDRY, Francois; BEDEL, Aurelie; VENDRELY, Veronique; DABERNAT, Sandrine 2022-08-31T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/203550 GALVIN, Angeline; BERTRAND, Nicolas; BOULAHSSASS, Rabia; DE DECKER, Laure; DORVAL, Etienne; CLAIRAZ, Béatrice; CASTAIGNÈDE, Monique; MOUREY, Loic; BALDINI, Capucine; BAUVIN, Eric; JACQUES, Beatrice; MALLON, Isabelle; DURAND-ZALESKI, Isabelle; GUÉRIN, Olivier; KROURI, Sadek; SOUBEYRAN, Pierre 2024-01-01T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/170053 HERNANDEZ RUIZ, Virgilio; LETENNEUR, Luc; FULOP, Tamas; HELMER, Catherine; ROUBAUD, Claire; AVILA-FUNES, Jose Alberto; AMIEVA, Helene 2022-07-22T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/188309 HERNANDEZ-RUIZ, Virgilio; ROUBAUD-BAUDRON, Claire; VON CAMPE, Hugo; RETUERTO, Noelia; MEGRAUD, Francis; HELMER, Catherine; AMIEVA, Helene; PERES, Karine 2024-01-23T00:00:00Z https://oskar-bordeaux.fr/handle/20.500.12278/202012 CANTARELLA, Simona; VEZZOLI, Marco; CARNEVALI, Davide; MORSELLI, Marco; ZEMKE, Nathan R; MONTANINI, Barbara; DAUSSY, Coralie F; WODRICH, Harald; TEICHMANN, Martin; PELLEGRINI, Matteo; BERK, Arnold J; DIECI, Giorgio; FERRARI, Roberto 2024-09-09T00:00:00Z